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马铃薯StNAC72基因克隆及表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 巩檑 1 ; 甘晓燕 1 ; 张丽 1 ; 陈虞超 1 ; 聂峰杰 1 ;

作者机构: 1.宁夏农业生物技术重点实验室

关键词: 马铃薯;StNAC72;基因克隆;序列分析;基因表达

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2016 年 14 卷 10 期

页码: 2589-2595

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: NAC转录因子在应答非生物胁迫中具有重要的调节作用。本研究以宁薯4号叶为材料,应用RT-PCR技术从已建立的转录组测序数据库中获得了马铃薯StNAC72基因全长序列,对其序列特征进行生物信息学分析;并应用real-time PCR技术分析了干旱和干旱后复水处理下根、匍匐茎和叶中该基因的时空表达特征。结果表明,StNAC72基因开放阅读框长1 074 bp,编码357个氨基酸,含有典型的NAM结构域。进化树聚类分析显示,该基因与拟南芥AtNAC072/RD26亲缘关系最近,属于NAC蛋白的SNAC(stressassociated NAC)组成员。转录水平表达分析显示,StNAC72基因表达量存在组织表达差异;干旱处理致使匍匐茎和叶中StNAC72均表现出上调表达模式,干旱处理后匍匐茎中StNAC72表达量较无处理的匍匐茎中上调近10倍;根中该基因对胁迫应答变化不明显,但表达量相较对照根中上调近1倍。干旱后复水处理促使StNAC72表达量下调,且以匍匐茎中该基因对胁迫应答最为显著,说明该基因可能参与干旱及水分刺激信号传导过程。研究结果为应用StNAC72改良马铃薯抗逆能力提供了基础理论数据。

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