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甘薯响应蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f. sp batatas)侵染的IbERF1基因序列与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘意 1 ; 陈培茹 1 ; 雷剑 2 ; 王连军 2 ; 柴沙沙 2 ; 靳晓杰 2 ; 王晴芳 2 ; 焦春海 2 ; 张文英 1 ; 杨新笋 2 ;

作者机构: 1.长江大学湿地生态与农业利用教育部工程研究中心

2.湖北省农业科学院粮食作物研究所

关键词: 甘薯;IbERF1;蔓割病;茉莉酸甲酯;乙烯利

期刊名称: 基因组学与应用生物学

ISSN: 1674-568X

年卷期: 2022 年 001 期

页码: 175-184

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了阐明甘薯(Ipomoea batatas)IbERF基因在生物胁迫中的作用,以高抗蔓割病(fusarium wilt)的品种‘鄂薯11’为供试材料,克隆到IbERF1基因,并对其进行生物信息学分析,同时对蔓割病病原菌(Fusarium oxysporum f. sp batatas)侵染、外施茉莉酸甲酯和乙烯利的基因表达模式进行了分析。生物信息学分析结果显示,IbERF1的CDS序列全长为588 bp,编码195个氨基酸;推测其编码不稳定的亲水性蛋白,蛋白分子质量为21.97 ku,等电点为5.11。IbERF1启动子区存在多种类型的启动子顺式作用元件,如植物激素应答元件Myb和胁迫响应元件MYC、MYB。多序列比对及系统进化树分析结果表明,IbERF1蛋白与日本牵牛花InERF1B-like的亲缘关系最近。亚细胞定位预测以及实验显示IbERF1蛋白定位于细胞核。蛋白二级结构预测显示,IbERF1蛋白含无规则卷曲结构27.69%,α-螺旋结构53.85%,延伸链结构12.31%,β-转角结构6.15%。实时荧光定量PCR分析结果显示,蔓割病病原菌侵染2 h和侵染4 h后,‘鄂薯11’的IbERF1表达量显著提高(P<0.05);茉莉酸甲酯和乙烯利各处理2,4和12 h,其表达量也显著提高。综上,IbERF1受蔓割病病原菌、茉莉酸甲酯以及乙烯利诱导表达。

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