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小鹅瘟病毒GPV-YG株主要开放性阅读框架核苷酸序列分析

文献类型: 中文期刊

作者: 葛艳 1 ; 尤永进 1 ; 徐泉兴 1 ; 陈谊 1 ; 饶忠 1 ;

作者机构: 1.上海市农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: 小鹅瘟病毒;开放性阅读框架;核苷酸序列

期刊名称: 上海农业学报

ISSN: 1000-3924

年卷期: 2005 年 21 卷 02 期

页码: 11-15

收录情况: CSCD

摘要: 通过PCR技术分段扩增小鹅瘟病毒(Gooseparvovirus,GPV)扬州分离株GPV YG的2个主要开放性阅读框架(openreadingframe,ORF)基因,对扩增产物进行核苷酸序列测定,其结果在GenBank登录。将上述序列与登录的国外参考株GPV-B株作比较,GPV-YG主要ORF核苷酸序列与GPV-B的同源性为94%,显示二者亲缘关系密切。在此基础上,分别确定了GPV-YG编码结构蛋白和非结构蛋白的基因组序列,并推导出GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的相应的氨基酸序列,GPV-YG与GPV B结构蛋白的氨基酸序列同源性为96.4%,非结构蛋白同源性为97.9%,由此进一步分析了GPV-YG结构蛋白和非结构蛋白的氨基酸序列与功能特征。同时,将GPV-YG主要ORF与番鸭细小病毒(MuscovyDuckParvovirus,MDPV)FM作比较,核苷酸序列同源性为80%,非结构蛋白推导氨基酸序列同源性为89.6%,结构蛋白为84.6%。

  • 相关文献

[1]我国人和猪戊型肝炎病毒(HEV)的基因型及其流行状况分析. 朱于敏,董世娟,司伏生,于瑞嵩,于晓明,沈世缘. 2011

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