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大豆BAC克隆基因注释

文献类型： 中文期刊

作者： 王囡囡 1 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院佳木斯分院

关键词： 大豆BAC克隆;序列比对;基因注释

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2010 年 0 卷 12 期

页码： 110-112+117

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 根据来源于大豆BAC克隆库中的基因组序列,与其比对的基因或蛋白质序列可以从一些数据库中搜索,如GenBank序列数据库、EMBL数据库、PDB数据库等,然后利用NCBI的Entrz程序在数据库中搜索大豆基因类似物,获取其登录号及核苷酸序列,以及这些基因编码的氨基酸序列,通过GENSCAN等软件分析,得出的是与拟南芥等物种序列比对的结果,根据GENSCAN的预测结果,可以初步得知序列长度、基因数目及具有编码某种功能蛋白的基因存在的可能性,进而对预测出的氨基酸或核苷酸序列利用数据库NCBI中的BLAST进行序列的相似性搜索及比对分析,寻找其保守区域。最后对其功能基因进行注释。

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