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小麦CBL4基因密码子使用特征分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈文烨 1 ; 焦义然 2 ; 杨军峰 2 ; 刘永伟 2 ; 杨帆 2 ; 董福双 2 ; 王海波 2 ; 杜进民 2 ; 周硕 3 ;

作者机构: 1.河北科技大学生物科学与工程学院;河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心;河北旺丰种业有限公司

2.;河北科技大学生物科学与工程学院;河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心;河北旺丰种业有限公司

3.;河北科技大学生物科学与工程学院;河北省农林科学院遗传生理研究所/河北省植物转基因中心;河北旺丰种业有限公司;

关键词: 小麦;CBL4;相对同义密码子使用度;密码子偏好性

期刊名称: 河南农业科学

ISSN: 1004-3268

年卷期: 2018 年 47 卷 08 期

页码: 11-16

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用Codon W和Usage Codon软件分析小麦CBL4基因密码子偏好性,并将其与其他17种不同目植物CBL4基因密码子偏好性进行比较,利用最小进化法分析多种植物的亲缘关系,以期为小麦CBL4基因改良以提高对干旱、低温和盐胁迫等逆境的抗性提供理论依据。结果表明,GC含量对小麦CBL4基因密码子偏好性具有重要的影响,小麦的G+C所占比例达58.0%,其中以第3位GC含量为主,而马铃薯对密码子的使用特征与小麦差异最大,形成鲜明的对比。小麦偏好使用CUC、AGG、UAA、AUC、GUG、GCG、ACG、UGC和GGC密码子,小麦等植物密码子偏好性结果与系统发育分析得出的亲缘关系结果一致。

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