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大豆花叶病毒黄淮5号株系的基因组全序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈炯 1 ; 黎昊雁 1 ; 尚佑芬 2 ; 陈剑平 2 ;

作者机构： 1.浙江大学生命科学学院

2.浙江省农业科学院农业部和浙江省重点病毒实验室

关键词： 大豆花叶病毒;株系;致病性;序列分析

期刊名称： 病毒学报

ISSN： 1000-8721

年卷期： 2002 年 18 卷 03 期

页码： 270-274

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 测定了大豆花叶病毒 (SMV)我国黄淮 5号 (Y5 )株系的基因组全序列。该病毒基因组全长 95 85个核苷酸 ,3′-末端具 poly(A)尾 ,包含单一开放读码框 ,编码一个 349 2kD的多聚蛋白。基因组全序列和美国SMVG2和G7株系的核苷酸同源性分别为 97 4 %和 96 9%。多聚蛋白酶解后产生马铃薯Y病毒属典型的 10个成熟蛋白。Y5、G2和G73个株系的不同成熟蛋白间氨基酸序列的同源性为 89 6 %～ 10 0 %。多重比较分析表明 ,Y5株系P1蛋白N -末端区域与G2和G7存在明显差异。进一步分析显示 ,这 3个株系的 6K1、6K2、NIa -Pro、NIa -VPg、NIb蛋白中心区域和CP蛋白高度保守 ,P1蛋白N -末端 ,CI和P3蛋白C -末端以及HC -Pro蛋白变异较大 ,但是美国G2和G7株系已报道序列P1蛋白区域存在可能的测序错误

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