文献类型: 中文期刊
作者: 孙超 1 ; 刘志鸿 1 ; 杨爱国 1 ; 周丽青 1 ; 吴彪 1 ; 严加坤 1 ; 侯丫 1 ; 董春光 1 ;
作者机构: 1.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室
关键词: 黑龙江河蓝蛤(Potamocorbula amurensis);线粒体;16S r RNA;COI;遗传分化
期刊名称: 海洋科学
ISSN: 1000-3096
年卷期: 2015 年 39 卷 01 期
页码: 39-45
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 采用通用引物对辽宁盘锦、辽宁大连、山东日照的3个地理群体黑龙江河蓝蛤(Potamocorbula amurensis)COI和16S r RNA序列进行扩增、测序分析,得到30条658bp的COI基因部分序列和27条450 bp的16S r RNA基因部分序列。其中COI和16S r RNA基因部分序列T、C、A、G和A+T的平均含量分别为45.4%和32.0%、13.5%和13.3%、20.7%和29.3%、20.4%和25.3%、66.1%和61.3%,AT含量高于GC含量,这与其他软体动物门动物的COI和16S r RNA的观测结果相近。COI和16S r RNA分别检测到了24个单倍型、43个核苷酸多态位点和9个单倍型、19个核苷酸多态性位点。AMOVA分析表明,3个群体间COI和16S r RNA部分基因总遗传分化系数分别为Fst=0.0090(P<0.001)和Fst=0.0674(P<0.001),群体内遗传分化远大于群体间、群体内存在较高的遗传分化。用NJ法构建分子进化树,3个地理群体的黑龙江河蓝蛤聚为一个族群,有少数个体和其他群体的个体聚在一起。
- 相关文献
[1]光滑河蓝蛤3个野生群体线粒体COI基因遗传多样性研究. 孙超,刘志鸿,杨爱国,周丽青,吴彪,严加坤,侯丫,董春光. 2013
[2]东黄海沙海蜇群体线粒体COI基因序列多态性. 刘敏,程家骅,马凌波,凌建忠,李建生. 2010
[3]4种河蓝蛤线粒体COI和16S rRNA基因序列的种间遗传分析. 孙超,刘志鸿,杨爱国,周丽青,吴彪,严加坤,侯丫,董春光. 2014
[4]大西洋鲑杀鲑气单胞菌无色亚种的分离鉴定和致病性研究. 李绍戊,王荻,连浩淼,卢彤岩,刘红柏,尹家胜. 2015
[5]短吻红舌鳎鱼卵、仔鱼的DNA条形码和形态学鉴定. 周晓梦,郭书新,宋娜,张秀梅. 2017
[6]栉孔扇贝、虾夷扇贝及其杂交子代线粒体COI和Cytb基因遗传多样性分析. 于涛,吴彪,杨爱国,周丽青,刘志鸿. 2016
[7]基于种特异性PCR及线粒体基因标记的天津沿海牡蛎物种多样性研究. 黄津伟,张天喆,高燕,吴弘,高雨,闫春财,胡利莎. 2019
[8]基于COI序列的长江中上游鲢6个地理群体遗传多样性分析. 沙航,罗相忠,李忠,邹桂伟,梁宏伟. 2018
[9]长江上游中华纹胸鮡遗传多样性及遗传结构研究. 张力文,田辉伍,陈大庆,刘绍平,段辛斌,汪登强. 2020
[10]基于线粒体16S rRNA和COI序列的江苏启东海域4种贝类遗传多样性分析. 闫永斌,葛玉双,程起群,范瑞良,李楠楠,全为民. 2022
[11]DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究. 张驰,刘海平,马波,王万良,曾本和,牟振波. 2019
[12]基于线粒体COI基因序列的磷虾目分子系统进化. 谌微,马春艳,冯春雷,王伟,王鲁民,马凌波. 2018
[13]北部湾3种金线鱼属鱼类COI基因序列的比较分析. 董丽娜,黄梓荣,艾红,卢伟华,李希国,李娜娜,李夏,李永振. 2011
[14]基于DNA条形码基因和核基因的美丽小条鳅隐存多样性研究. 高尚,向登高,李跃飞,李捷,陈蔚涛. 2023
[15]基于线粒体COI和D-loop序列的黑龙江流域蛇(鱼句)种群遗传结构分析. 胡宗云,杨培民,宋红梅,牟希东. 2023
[16]我国不同地理群体栉江珧遗传多样性及系统发生分析. 严加坤,杨爱国,周丽青,吴彪,白临建,刘志鸿. 2013
[17]多鳞四指马鲅和四指马鲅种群遗传特征的研究. 张帅,李敏,闫帅,朱江峰,徐姗楠,陈作志. 2022
[18]中国文昌鱼系统分类的线粒体COI和Cyt b基因片段分析(英文). 罗家聪,肖永双,宋林,高天翔,张岩. 2007
[19]南极鱼类DNA条形码及分子系统进化研究. 赵娜,马春艳,宋炜,冯春雷,王鲁民,张凤英,蒋科技,赵宪勇,马凌波. 2018
[20]基于线粒体COI基因的中华鳖3个品系遗传多样性分析. 梁宏伟,曹力欢,罗相忠,朱成骏,崔峰,邹桂伟. 2021
作者其他论文 更多>>
-
青岛典型潮间带贝类的种类组成与群落特征
作者:原大山;刘志鸿;马培振;孙秀俊;周丽青;李转转;徐东;吴彪
关键词:潮间带;底质;群落结构;多样性;优势种
-
圆斑星鲽雌性特异DNA分子标记开发及遗传性别鉴定方法的建立
作者:郑卫卫;徐文腾;刘洋;陈亚东;杨涛;席晓晴;刘志鸿;徐东;秦搏;陈松林
关键词:圆斑星鲽;雌性特异DNA分子标记;遗传性别鉴定;基因组重测序
-
盐度对近江牡蛎生理及相关基因表达的影响
作者:杨苗苗;夏苏东;刘志鸿;孙秀俊;周丽青;马培振;李转转;吴彪
关键词:近江牡蛎;盐度;生理变化;基因表达
-
我国水产种质资源利用安全战略研究
作者:王娜;邵长伟;刘志鸿;张晓雯;廖梅杰;高保全;吴彪;孙秀俊;陈张帆;刘宇岩;陈松林
关键词:水产种质资源;利用安全;基因组资源共享平台;经济性状遗传机制解析;知识产权保护
-
涠洲岛石蚝闭壳肌营养成分分析与品质评价
作者:马培振;陈默;梁彬兰;周于娜;李鹏飞;李翔伦;吴彪
关键词:舌骨牡蛎;闭壳肌;氨基酸;脂肪酸;品质评价
-
菲律宾蛤仔幼虫DNA的高效提取及在遗传分析中的应用
作者:张磊;许星鸿;刘志鸿;吴彪;周丽青;李转转;马培振;孙秀俊
关键词:基因组DNA;D形幼虫;遗传分析;COX1;16SrRNA;菲律宾蛤仔
-
近江牡蛎AGL基因的分子特征及其在糖原分解中的作用
作者:赵丽艳;李转转;马培振;刘志鸿;孙秀俊;周丽青;吴彪
关键词:近江牡蛎;AGL基因;糖原分解;RNA干扰;糖原含量




