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海豚基因组中硒蛋白基因的生物信息学预测

文献类型： 中文期刊

作者： 陈华 1 ; 姜亮 1 ; 倪嘉缵 2 ; 刘琼 3 ; 张继红 4 ;

作者机构： 1.深圳大学生命科学学院

2.中国科学院长春应用化学研究所

3.华中科技大学化学系

4.中国水产科学研究院黄海水产研究所

关键词： 硒;硒蛋白;海豚;基因组;基因识别

期刊名称： 科学通报

ISSN： 0023-074X

年卷期： 2012 年 57 卷 11 期

页码： 32-39

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 硒蛋白中的硒以硒代半胱氨酸(Sec)的形式存在.Sec由传统的终止密码子TGA编码.由于在可读框中难以区分TGA密码子在硒蛋白中的功能,硒蛋白基因的预测非常困难.利用本实验室建立的真核生物硒蛋白基因预测系统,从海豚基因组中识别了包括含2个Sec的2型碘甲腺氨酸脱碘酶(DI2)、具有可变剪切编码区的1型碘甲腺氨酸脱碘酶(DI1)及谷胱甘肽过氧化物酶(GPX)、硒蛋白P(SelP)等16个硒蛋白,从基因信息的角度探索了海豚中硒蛋白与其特殊生存环境及进化阶段的关系等问题.

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