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基于线粒体DNA D-loop序列的黄斑篮子鱼群体遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 黄小林 1 ; 李文俊 1 ; 林黑着 1 ; 杨育凯 1 ; 李涛 1 ; 虞为 1 ; 黄忠 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院南海水产研究所广东省渔业生态环境重点实验室;中国水产科学研究院南海水产研究所深圳试验基地

关键词: 线粒体DNA D-loop;黄斑篮子鱼;群体遗传多样性

期刊名称: 热带海洋学报

ISSN: 1009-5470

年卷期: 2018 年 04 期

页码: 45-51

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 对中国华南沿海不同地理群体的黄斑篮子鱼(Siganus oramin)进行遗传多样性分析,测定了漳州东山湾(DS)、深圳大亚湾(DY)、深圳大鹏湾(DP)、阳江沙扒湾(SB)4个群体共计100尾黄斑篮子鱼线粒体DNA D-loop序列。结果显示:序列长度约828bp,包含72个变异位点,50个单倍型,A、T、C、G含量平均为31.2%、31.1%、20.8%和16.9%;单倍型多样性指数为0.893±0.053~0.957±0.030,核苷酸多样性指数为0.0105±0.0031~0.0179±0.0031,表现为高单倍型多样性而低核苷酸多样性的特点;群体内的遗传距离0.0107~0.0184,群体间的遗传距离0.0112~0.0172,AMOVA分析显示群体间的分子变异占0.66%,群体内占99.34%;中性检验结果表明Fu’s Fs检验值为显著的负值(-16.7079,p<0.01);核苷酸不配对分布图呈单峰,表明黄斑篮子鱼演化过程中经历过种群扩张事件,推测扩张时间约在1.38~4.60万年前。综上,华南沿海岸4个黄斑篮子鱼群体间不存在显著的遗传分化,可划归一个管理单元,而沙扒湾(SB)群体遗传多样性水平相对较高,应优先加以保护。

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