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花生CC-NBS-LRR家族基因鉴定及在青枯病和网斑病胁迫下的表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 汪晓 1 ; 齐飞艳 2 ; 孙子淇 2 ; 郑峥 3 ; 徐静 3 ; 王娟 3 ; 韩锁义 3 ; 黄冰艳 3 ; 董文召 3 ; 张新友 1 ;

作者机构: 1.沈阳农业大学

2.神农种业实验室

3.河南省作物分子育种研究院/国家生物育种产业创新中心/农业农村部黄淮海油料作物重点实验室/河南省油料作物遗传改良重点实验室/河南生物育种中心有限公司

关键词: 花生;CC-NBS-LRR;青枯病;网斑病;表达分析

期刊名称: 中国油料作物学报

ISSN: 1007-9084

年卷期: 2025 年 47 卷 002 期

页码: 344-355

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确花生基因组中CC-NBS-LRR(CNL)的家族成员及其功能,对其基因家族成员进行生物信息学分析和表达模式分析,研究花生如何响应病害胁迫。以花生基因组序列为参考,利用Pfam、HMMER、NCBI和CoiledCoil等软件和在线网站筛选,共鉴定得到85个AhCNL家族成员,分布在20条染色体中的15条上,以A02和A12染色体上分布最多,并且大多成簇存在于染色体末端;系统进化树分析表明其可分为4个亚族,每个亚族中的基因成员保守性较高;共线性分析表明在物种内有16对基因存在共线性关系,物种间分析表明相比于拟南芥和苜蓿,花生与大豆的CNL具有较高的同源性;启动子上含有大量与激素相关和抗病相关的顺式作用元件;大部分CNL家族基因在病菌入侵前后均不表达,少部分基因受到病菌诱导后表达量有变化。

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