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基于matK基因和ITS序列的江苏地方豆类植物的亲缘关系研究

文献类型: 中文期刊

作者: 王彤 1 ; 刘静 2 ; 郭月 2 ; 袁娜 2 ; 杜建厂 3 ;

作者机构: 1.南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室;江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室

2.;南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室;江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室

3.;南京农业大学园艺学院/作物遗传与种质创新国家重点实验室;江苏省农业科学院农业生物技术研究所/江苏省农业生物学重点实验室;

关键词: 豆类植物;matK基因;ITS序列;亲缘关系;分化时间

期刊名称: 南京农业大学学报

ISSN: 1000-2030

年卷期: 2017 年 05 期

页码: 795-803

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: [目的]为探究江苏地方豆类植物之间的亲缘关系,从分子水平上对14种豆科植物进行了深入分析,旨在为后续豆类植物的种质创新和遗传改良提供理论依据。[方法]对14种豆类植物的mat K基因和ITS序列的扩增片段进行PCR产物直接测序,并结合Gen Bank数据库中的大豆(Glycine max)、菜豆(Phaseolus vulgaris)、红小豆(Vigna angularis)和绿豆(Vigna radiata)4种豆类植物基因组序列,利用Clustal W、MEGA 6.0、Bio Edit软件对这18种材料的mat K基因和ITS序列分别进行比对和分析,并以百脉根(Lotus corniculatus)为外类群,分别构建系统进化树并计算分化时间。[结果]18种豆类植物的mat K基因序列长度为750 bp,其中变异位点数为85,信息位点数为82,遗传距离的范围为0~0.099。ITS序列长度为795 bp,其中变异位点数为260,信息位点数为242,遗传距离的范围为0~0.292。以百脉根为外类群,用mat K基因序列和ITS序列分别构建的进化树显示,18种豆类植物可分为3组,即红小豆和绿豆分为一组,菜豆和大豆分别聚为一组。分化时间结果表明,大豆与菜豆的分化时间为19.02百万年前,菜豆与红小豆的分化时间为13.50百万年前,绿豆与红小豆的分化时间为2.94百万年前。[结论]序列分析和系统进化树的结果与形态学的特征基本一致,表明mat K基因和ITS序列可用于豆类植物属间亲缘关系分析。

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