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草鱼基因组中微卫星分子标记的制备及筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 马海涛 1 ; 鲁翠云 1 ; 于冬梅 1 ; 孙效文 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词： 草鱼;生物素;磁珠;微卫星

期刊名称： 上海水产大学学报

ISSN： 1004-7271

年卷期： 2007 年 16 卷 04 期

页码： 389-393

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用新型的生物素-磁珠吸附微卫星富集法与传统的放射性同位素杂交法相结合的方式,研究了草鱼(Ctenopharyngodon idella)基因组中存在的微卫星资源。结果,从1 000个细菌中,挑出90个阳性克隆,把其中45个进行测序分析,在这些序列中共含有68个微卫星核心序列,有55个含有重复次数大于5次的微卫星核心序列。其中,单一型标记49个,占72%,包括CA重复单元共22个,GT重复单元共18个,其他重复单元为9个;在72%的单一型标记中,完美单一型微卫星标记为44个,占65%。另外,混合型标记共19个,13为完美混合型;在所有微卫星标记中,CA重复类型最普遍,依次为GT、GA等。在68个微卫星标记中,有15个依据引物设计原理设计了引物。

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