文献类型： 中文期刊
作者： 王丹 1 ; 姚红 1 ; 王卫民 1 ; 邹桂伟 1 ; 王汉平 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院长江水产研究所;俄亥俄州立大学水生动物遗传与育种实验室;华中农业大学水产学院
关键词： 黄金鲈; EST;微卫星; EST-SSR;基因注释
期刊名称： 水生生物学报
ISSN： 1000-3207
年卷期： 2018 年 42 卷 06 期
页码： 1186-1193
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 黄金鲈是美国中西部地区重要的淡水经济型鱼类。TypeⅠ型标记对于比较作图和遗传学研究有相当重要的作用,但是黄金鲈的TypeⅠ标记数量相当少。研究通过数据挖掘的方法从公共数据库中挖掘黄金鲈的TypeⅠ型即EST-SSR标记。实验结果分析了21968条EST序列,约14.4%的序列包含不同类型的核心重复单元。CA重复是最丰富的二碱基重复单元。从中挑选62条包含SSR的EST序列设计引物,筛选得到15对多态的微卫星位点。群体遗传学参数显示15对EST-SSR位点的等位基因数范围为4—19(平均数为9),观测杂合度和期望杂合度的范围分别为0.103—0.929和0.116—0.934,有4个位点偏离HWE平衡。研究得到的EST-SSR标记适用于黄金鲈的群体遗传学和基因组作图研究。
- 相关文献
[1]基于高通量测序的杂交鳢转录组数据分析. 黄勇,龚望宝,陈海刚,孙西红. 2019
[2]基于RNA-Seq高通量测序技术的大口黑鲈转录组分析. 黄勇,龚望宝,陈海刚,熊建利,孙西红. 2019
[3]淡水定居型刀鲚无间隙基因组组装. 马凤娇,王慧,任泷,刘凯. 2025
[4]魁蚶微卫星富集文库的构建及不同地理种群遗传多样性分析. 田吉腾,刘志鸿,杨爱国,刘萍. 2011
[5]江西三种红鲤群体遗传多样性及亲缘关系的SSR分析. 刘福军,贾智英,孙效文. 2008
[6]荷包红鲤与德国镜鲤正反杂交组遗传结构的微卫星分析. 池喜峰,贾智英,李池陶,石连玉. 2010
[7]牙鲆回交、全同胞近交及其亲本家系的微卫星研究. 王磊,陈松林,田永胜,邓寒. 2011
[8]大菱鲆4个引进地理群体遗传多样性的微卫星分析. 侯仕营,马爱军,王新安,黄智慧,薛宝贵,杨志,曲江波. 2011
[9]芙蓉鲫(芙蓉鲤♀×红鲫♂)及其原始亲本间的遗传关系. 王金龙,刘臻,李传武,王冬武,曾国清,鲁双庆. 2010
[10]5个红鳍东方鲀养殖群体微卫星DNA遗传多态性分析. 陆丽君,马爱军,王新安,岳亮,孟雪松,翟介明,谭林涛,侯仕营. 2013
[11]牙鲆骨骼生长性状与微卫星标记的相关性分析. 安泉泉,刘海金,王桂兴,刘永新,刘奕. 2012
[12]海带转录组SSR序列特征及其相关基因功能分析. 李秋莹,张杰,姚建亭,王秀良,段德麟. 2016
[13]牙鲆家系亲权鉴定的微卫星DNA标记分析. 刘永新,孙朝徽,王玉芬,刘奕,刘英杰. 2015
[14]4个虹鳟养殖品系的分子鉴定和遗传多样性分析. 徐浩,鲁翠云,郭薇,孙效文. 2013
[15]牙鲆5个养殖群体的遗传多样性分析. 刘海金,朱晓琛,孙效文,杨立更,薛玲玲,毛连菊. 2008
[16]精子冷冻保存对大菱鲆后代遗传结构影响的微卫星分析. 陈松林,刘云国,季相山. 2005
[17]松浦红镜鲤保种群体的遗传结构. 李盛文,贾智英,柏盈盈,李池陶,石连玉. 2014
[18]长江中上游两个鲢群体遗传变异的微卫星分析. 王长忠,梁宏伟,邹桂伟,罗相忠,李忠,田华,呼光富. 2008
[19]牙鲆渤海自然群体的遗传多样性分析. 刘永新,朱以美,刘英杰,高磊,方辉,韩刚,王玉芬,姜秀凤,刘海金. 2013
[20]牙鲆卵裂雌核发育纯系的建立及鉴定. 齐文山,田永胜,姜静,王磊,张文婷,陈红林,张英平,刘万军,孙德强. 2014
作者其他论文 更多>>
-
不同流速对大口黑鲈幼鱼生长性能、肠道消化与抗氧化能力的影响
作者：葛恒;郭红会;李怡雯;柴毅;邹桂伟;梁宏伟
关键词：大口黑鲈;流速;生长发育;肠道;转录组
-
急性高温胁迫对河鲈组织损伤、抗氧化酶活性及热休克蛋白基因表达的影响
作者：刘怡;陈朋;王丹;徐滨;陈庚;徐进
关键词：河鲈(Perca fluviatilis);高温胁迫;抗氧化酶;组织病理;热休克蛋白基因
-
皮质醇(COR)介导的氨氮抑制团头鲂免疫功能
作者：郭红会;王勋伟;葛恒;王羽慧;李怡雯;李欣月;邹桂伟;梁宏伟;李莉
关键词：氨氮;皮质醇;免疫功能;应激;团头鲂（Megalobrama amblycephala）
-
苯唑卡因麻醉对鲢肝肾超氧化物歧化酶、过氧化氢酶酶活及部分免疫基因表达的影响
作者：罗相忠;梁宏伟;李晓晖;周同;张春燕;邹桂伟;崔峰
关键词：鲢(Hypophthalmichthys molitrix);苯唑卡因;酶活;IL-10;TNF-α;INF-γ;IgM
-
中华绒螯蟹亲蟹群体形态性状对体质量的影响分析
作者：张金刚;吴怡迪;郭红会;罗相忠;邹桂伟;梁宏伟
关键词：中华绒螯蟹;形态性状;相关分析;通径分析
-
鱼类环境耐受性与抗逆性育种研究进展
作者：郭红会;胡振;张金刚;邹桂伟;梁宏伟
关键词：水产种业;水产养殖;环境胁迫;抗逆育种
-
池塘健康高效培育大宗淡水鱼乌仔技术
作者：罗相忠;乐继高;邹桂伟;梁宏伟
关键词：
