文献类型： 中文期刊

作者： 孟国良 ¹ ; 杜卓 ² ; 张晓兰 ³ ; 杨瑞恒 ⁴ ; 王永会 ¹ ; 陆焦焦 ⁵ ; 余丹 ⁵ ; 董彩虹 ² ; 姚一建 ² ; 李熠 ⁵ ;

作者机构： 1.中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室

2.真菌学国家重点实验室

3.中国科学院微生物研究所

4.上海市农业科学院食用菌研究所

5.扬州大学旅游烹饪学院

关键词： 真菌;基因组组装;芽生孢子;染色体计数;Hi-C

期刊名称： 应用昆虫学报

ISSN： 2095-1353

年卷期： 2021 年 006 期

页码： 1330-1338

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】冬虫夏草Ophiocordyceps sinensis是一种重要的食药用真菌,仅分布在青藏高原及其周边高海拔地区,具有独特的生存环境、生物学特性以及显著扩张的基因组。本研究旨在确定冬虫夏草菌的染色体数量,为该物种的基因组测序、进化、遗传和分子生物学研究奠定基础,也为其他虫草菌染色体计数研究提供参考。【方法】二、三代测序辅以Hi-C组装,结合显微观察研究冬虫夏草的染色体数量。选择已组装获得基因组完成图的冬虫夏草1229菌株,首先利用昆虫细胞培养液培养获得芽生孢子,芽生孢子经秋水仙素和溶壁酶处理,获得细胞有丝分裂中期分散的染色体,DAPI荧光染色后使用激光共聚焦显微镜观察计数,结合基因组组装和显微观察的结果确定冬虫夏草染色体数量。【结果】二、三代测序辅以Hi-C组装,得到6条包含两端端粒的完整染色体,染色体之间显示出较强的端粒互作;显微观察结果也支持冬虫夏草1229菌株的染色体数量为6条。【结论】冬虫夏草菌的基因组包含6条染色体,芽生孢子是观察冬虫夏草菌染色体的理想材料。