文献类型： 中文期刊

作者： 周陈力 ¹ ; 郭婷 ¹ ; 纪光燕 ¹ ; 纪开萍 ¹ ; 鲍大鹏 ¹ ; 杨瑞恒 ¹ ;

作者机构： 1.上海市农业科学院食用菌研究所

关键词： 组学;转录因子;漆酶;加权基因共表达调控网络

期刊名称： 北方园艺

ISSN： 1001-0009

年卷期： 2023 年 016 期

页码： 108-116

收录情况： 北大核心

摘要： 以暗褐网柄牛肝菌(Phlebopus portentosus)为试材,采用基因组测序和转录组分析方法,研究转录因子类型、不同发育阶段的表达模式以及对漆酶的调控作用,以期为暗褐网柄牛肝菌子实体发育调控机制研究提供参考依据.结果表明:在暗褐网柄牛肝菌基因组中共预测得到140个转录因子编码基因,分属于10个不同家族,C2H2型转录因子最多,其次为C3 H型,这些转录因子参与调控催化活性、生物活性以及代谢过程.转录因子在菌丝体阶段、原基阶段以及采收阶段的表达模式存在差异性,调控不同的生物过程.通过基因组注释信息以及结构域的解析发现了6个漆酶基因,根据不同发育阶段的表达情况,分为4个不同的家族:始终不表达、菌丝体时期高表达、原基子实体时期高表达、稳定表达.有6个转录因子对4个漆酶基因起到了调控作用,其中SRF型转录因子控制了菌丝体时期高表达的漆酶基因,具有正相关的关系,Sox1型转录因子控制了原基子实体漆酶的表达,呈负相关.转录因子和漆酶在子实体发育过程中均起到了一定的调控作用.