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茶树3个TPT基因的鉴定与表达

文献类型： 中文期刊

作者： 曹丹 1 ; 刘艳丽 1 ; 马林龙 1 ; 李娟 1 ; 金孝芳 1 ;

作者机构： 1.湖北省农业科学院果树茶叶研究所;茶学教育部重点实验室/国家植物功能成分利用工程技术研究中心/植物功能成分利用省部共建协同创新中心/农业农村部园艺作物基因资源评价利用重点实验室/湖南农业大学

关键词： 茶树;Triose phosphate translocator(TPT);生物信息学;表达分析;功能

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2023 年 36 卷 009 期

页码： 1852-1858

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]进行茶树磷酸丙糖转运蛋白(Triose phosphate translocator,TPT)基因鉴定和表达模式分析,为探索其基因功能和茶树抗性育种提供理论参考.[方法]基于茶树全基因组序列,利用生物信息学方法筛选鉴定TPT基因,分析其在茶树不同组织中的表达特性及其在冷胁迫、干旱胁迫、盐胁迫、茉莉酸甲酯(MeJA)处理和硒处理中的表达情况.[结果]从茶树基因组中鉴定到3个含有TPT结构域的基因,序列长度为807-1635 bp,分别编码268-544个氨基酸;3个TPT蛋白均呈弱碱性或者碱性,均为稳定蛋白、疏水蛋白;亚细胞定位预测3个TPT蛋白位于质膜或叶绿体;系统进化分析将茶树TPT分为2组,基因结构和保守基序分析表明,3个茶树TPT基因结构和保守结构域大致相同;启动子顺式作用元件分析表明,茶树TPT基因的启动子区含有多个光反应、胁迫和激素等响应元件.基因表达分析发现CsTPT3在芽和叶片中有较高的表达,可能与茶树光合作用有关;CsTPT2在不同逆境下均呈现出显著下调表达的趋势,推测该基因在应对茶树低温、干旱、MeJA、盐和外源高浓度硒等胁迫过程中起着负调控作用.[结论]CsTPT基因可能参与了茶树响应逆境胁迫的过程.

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