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茶树MYC基因家族生物信息学及其表达特性

文献类型: 中文期刊

作者: 曹丹 1 ; 刘艳丽 2 ; 马林龙 2 ; 金孝芳 2 ;

作者机构: 1.湖北省农业科学院果树茶叶研究所

2.湖北省农业科学院

关键词: 茶树;髓细胞增生蛋白基因家族;生物信息学;基因表达;硒

期刊名称: 湖南农业大学学报(自然科学版)

ISSN: 1007-1032

年卷期: 2021 年 47 卷 003 期

页码: 291-298

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 采用生物信息学方法对茶树髓细胞增生蛋白(myelocytomatosisproteins,MYCs)基因家族成员的理化性质、进化关系、蛋白质结构、顺式作用元件进行分析,运用qRT–PCR技术研究MYC基因家族成员在茶树中的表达.结果表明:茶树MYC为不稳定蛋白、亲水蛋白、非分泌蛋白、非跨膜蛋白,均呈酸性;MYC基因家族6个成员都定位于细胞核中;基因家族二级结构主要以无规则卷曲和α–螺旋为主,均含1个外显子,无内含子,motif分布相似的成员,其三级结构也相似;茶树MYC基因和拟南芥的亲缘关系更近;茶树MYC家族基因启动子均主要含有光信号、茉莉酸甲酯和脱落酸等3个顺式作用元件.qRT–PCR分析显示,MYC家族成员主要在茶树的根和种子中表达,可能在茶树对硒吸收累积过程中发挥调控作用.

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