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猪肌肉组织表达序列标签(ESTs)的分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王秀利 1 ; 仇雪梅 2 ; 刘娣 1 ;

作者机构: 1.黑龙江省农业科学院

2.大连水产学院生命科学与技术学院

关键词: 民猪;背最长肌;表达序列标签;基因表达谱

期刊名称: 黑龙江畜牧兽医

ISSN: 1004-7034

年卷期: 2007 年 2007 卷 08 期

页码: 31-33

收录情况: 北大核心

摘要: 研究构建了民猪肌肉组织cDNA文库,并在文库中随机挑选克隆进行测序,获得107个高质量的ESTs。经生物信息学分析,所研究的107个ESTs中,有98个单一克隆,其中71个为人类及其他物种的同源序列,23个为猪的已知ESTs,4个为未知ESTs。对这4个未知ESTs进行开放阅读框预测并进行BLASTn分析,没有找到高度同源的氨基酸序列。对已知功能基因表达谱的构建和分析结果表明:最多的是未分类,占47.88%;然后依次是基因/蛋白表达占26.76%、细胞代谢占9.86%、细胞结构/迁移占8.45%、细胞/机体防御占4.23%和细胞信号/传导占2.82%。

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