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甜瓜内源病毒CmEV的TaqMan RT-qPCR检测方法研究

文献类型: 中文期刊

作者: 赵立群 1 ; 张晓飞 1 ; 邱艳红 1 ; 刘慧 1 ; 张建 1 ; 杨静静 1 ; 张海军 1 ; 徐秀兰 1 ; 温常龙 1 ;

作者机构: 1.北京市农业技术推广站;农业农村部华北地区园艺作物生物学与种质创制重点实验室北京市农林科学院蔬菜研究所;农业农村部蔬菜种子质量监督检验测试中心

关键词: 甜瓜内源病毒;TaqMan探针法荧光实时定量PCR;葫芦科作物;种苗带毒

期刊名称: 园艺学报

ISSN: 0513-353X

年卷期: 2022 年 49 卷 011 期

页码: 2471-2478

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 甜瓜内源病毒(cucumis melo endornavirus,CmEV)是近年来发现的寄主广泛、发病率高、种传率高的重要病毒.利用CmEV基因组的序列信息设计特异性引物和探针,建立基于探针法的实时荧光定量 PCR(Real-Time Fluorescent Quantitative PCR with TaqMan probes,TaqMan RT-qPCR)的检测方法.该方法可以检测出1×10-2ng·μL-1的RNA和1.8×103 copies·μL-1的质粒,灵敏度是普通PCR的100倍.利用该方法检测了在北京、山东、辽宁、海南瓜类种苗主产区的甜瓜、西瓜、黄瓜与南瓜砧木11份种苗带毒情况,发现山东和海南各有1份甜瓜种苗携带CmEV.本研究建立的CmEV TaqMan RT-qPCR方法特异性好、灵敏度高,可为开展病毒精准鉴定、科学防控以及从源头遏制病毒传播提供技术支撑.

  • 相关文献

[1]TaqMan探针法实时荧光定量PCR检测西瓜潜隐病毒. 赵立群,邱艳红,张晓飞,刘慧,杨静静,张建,张海军,徐秀兰,温常龙. 2021

[2]葫芦科瓜类作物分子遗传图谱研究进展. 张海英,许勇,王永健. 2004

[3]海南三亚地区葫芦科作物白粉病菌生理小种分化的鉴定. 包海清,许勇,杜永臣,李劲松,杨晓峰. 2008

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