文献类型： 中文期刊

作者： 曾伟伟 ¹ ; 王庆 ¹ ; 张超 ¹ ; 张乐生 ¹ ; 刘宝芹 ¹ ; 刘永奎 ¹ ; 石存斌 ¹ ; 吴淑勤 ¹ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院

关键词： 草鱼呼肠孤病毒;S4基因;序列分析;遗传进化树

期刊名称： 生物学杂志

ISSN： 2095-1736

年卷期： 2012 年 29 卷 02 期

页码： 12-17

收录情况： CSCD

摘要： 草鱼呼肠孤病毒HZ08株是本实验室从患出血病草鱼体内分离到的一个新毒株,已完成部分基因序列的分析,其氨基酸序列的同源性和873株相比,仅为20%～30%之间。因序列差异较大,无法通过设计特异性引物来扩增和分析其基因序列,采用单引物扩增技术,对HZ08株S4基因进行序列分析表明:S4全长为2263 bp,最大的ORF编码717个氨基酸,推导出其表达的蛋白约为79 kDa。正如其他基因节段,基因末端也含有保守碱基序列5'(GUAAUUU…UUCAUC),3'。S4基因推导的氨基酸序列与同宿主的其他呼肠孤病毒的非结构蛋白NS1同源性最大,其次是和哺乳动物正呼肠孤病毒的非结构蛋白mu-NS以及禽呼肠孤病毒非结构蛋白NS1同源性较大,表明S4可能表达细胞骨架相关蛋白。基于S4推导出的氨基酸序列构建的系统进化树HZ08株单独作为一个分支,与同宿主的其他呼肠孤病毒亲缘关系比较近,而与其他呼肠孤病毒则相对较远。这提示HZ08株可能是多个毒株的遗传信息经长期的遗传进化而得,综合其它已知序列信息,推测HZ08株可能为呼肠孤病毒的一个新成员。