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适用变性梯度凝胶电泳分析的石油污染土壤微生物DNA模板制备的研究

文献类型： 中文期刊

作者： 韦超英 1 ; 杨滨银 1 ; 方新湘 2 ; 娄恺 3 ; 晁群芳 1 ;

作者机构： 1.新疆大学生命科学与技术学院

2.中国石油克拉玛依石化

3.新疆特殊环境微生物实验室

关键词： DNA提取;石油污染土壤;DGGE

期刊名称： 安徽农业科学

ISSN： 0517-6611

年卷期： 2011 年 39 卷 16 期

页码： 222-225+268

收录情况： 北大核心

摘要： [目的]为了快速、简便和经济地获得理化性质不同的石油污染土壤中微生物总DNA,以用于后续微生物群落结构分析及动态监测。[方法]采用3种提取方法对石油污染土壤中细菌总DNA进行提取,并通过DNA产量、纯度、片段大小、基因组完整性等对提取得到的DNA质量进行评价;并对16S rDNAV3可变区的PCR扩增产物进行DGGE分析。[结果]采用3种方法均能从石油污染土壤中提取得到相应的细菌DNA片段,且针对同一种提取方法,土壤理化性质的差异对DNA提取效果影响不明显,但不同方法提取得到的DNA在浓度和纯度上存在明显差异。采用3种方法提取得到的DNA量分别可达98.3、79.9和43.8 ng/μl。[结论]选取方法1提取基因组DNA并进一步纯化,纯化后的DNA分别采用引物F27/R1492和F357/R518进行16S rDNA及116S rDNAV3可变区的扩增,获得了条带清晰、浓度高、无污染的DNA目的片段;对其PCR扩增产物进行DGGE分析,得到的DGGE图谱可直观反应石油污染土壤中微生物的多样性及优势种群。

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