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海莲子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 张大栋 1 ; 周春霖; 任丽娟; 王茂文; 汤日圣; 马鸿翔;

作者机构： 1.江苏省农业科学院农业生物技术研究所

关键词： DnaJ-like基因;表达;生物信息学分析;海蓬子

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2006 年 022 卷 003 期

页码： 222-224

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从盐生植物海蓬子的抑制消减杂交文库中克隆了DnaJ-like基因的长609bp的DNA序列,编码1个202aa的开放阅读框,Northern Bloting显示该基因在检测子(200mmol/L NaCl)中的表达显著增强.生物信息学分析表明,在蛋白质水平上,该片段与拟南芥和水稻的同源性分别为6e-68和1e.58;在核酸水平上,该片段与拟南芥的同源性为3e-24.保守区分析显示,该片段含有DnaJ―like基因完整的J功能域(J―Domain,66aa),功能域在蛋白质水平与GenBank两种相关类型的J功能域的同源性分别为1e-11和9e-15.这为该基因的克隆及研究其在植物逆境胁迫中的作用奠定了基础.

  • 相关文献

[1]海蓬子DnaJ-like基因片段的表达和生物信息学分析. 张大栋,周春霖,任丽娟,王茂文,汤日圣,马鸿翔. 2006

[2]海蓬子中高亲和钾离子转运体SbHKT1基因的克隆、表达及生物信息学分析. 高媛媛,张保龙,杨郁文,沈新莲,倪万潮. 2010

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