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Allexivirus属的一个新成员——大蒜病毒E的基因组全序列测定和系统树分析

文献类型： 中文期刊

作者： 陈炯 1 ; 陈剑平 2 ;

作者机构： 1.浙江大学生命科学学院

2.浙江省农业科学院病毒学实验室

关键词： Allexivirus属;大蒜病毒E;核酸序列;分类

期刊名称： 科学通报

ISSN： 0023-074X

年卷期： 2001 年 46 卷 17 期

页码： 1463-1468

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 测定了一个从浙江余杭大蒜中分离到的Allexivirus属成员的基因组全序列. 单链正性病毒基因组含8451个核苷酸, 6个ORF. 与其他Allexivirus属成员的基因组全序列的核苷酸同源性仅为62.8%～64.8%; ORF1～ORF6编码蛋白的氨基酸同源性分别为67.6%～78.5%, 55.4%～66.2%, 56.7%～66.4%, 40.3%～55.6%, 66.3%～79.7%和52.2%～68.8%. 进一步分析显示, 此病毒与其他病毒的差异和该属中远缘病毒间的差异相似, 外壳蛋白核心区域氨基酸序列同源性仅为63.9%～79.8%, 远低于该属不同病毒的国际分类标准, 应归类为Allexivirus属的新成员, 命名为大蒜病毒E. 病毒不同编码蛋白序列的进化树分析也进一步证明了该病毒与其他病毒的亲缘关系.

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