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软腐病菌诱导的大白菜抑制差减杂交文库构建及分析

文献类型: 中文期刊

作者: 屈淑平 1 ; 马荣才 2 ; 崔崇士 1 ; 曹鸣庆 2 ;

作者机构: 1.东北农业大学园艺学院

2.北京农业生物技术研究中心

关键词: 软腐病;抑制差减杂交;表达序列标签;大白菜

期刊名称: 东北农业大学学报

ISSN: 1005-9369

年卷期: 2010 年 41 卷 07 期

页码: 45-51

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 利用抑制差减杂交技术构建了软腐欧文氏菌(Erwinia carotovora subsp.carotovora)侵染诱导的结球白菜叶片cDNA文库。文库质量检测表明,差减杂交效率较高,质量较好。随机挑取单克隆进行单向测序,获得1 107条长度大于100 bp、质量较好的ESTs序列。利用DNAstar5.0对上述ESTs进行聚类,共获取753个非冗余EST,包括有564个为单拷贝序列(Singletons)和189个重叠群(Contigs)。所获得的编码功能已知的EST有508个,将这些EST进行功能分类,可以看出所代表的基因参与植物体内的各种代谢反应,其中参与初级代谢和能量代谢的最多(33.3%),其次是参与抗病/防卫反应(12.6%)、再次为参与信号传导(11.4%)和蛋白质合成与加工(9.4%),参与细胞的结构与生长发育、物质运输、转录调控等过程的基因相对较少。RT-PCR分析结果表明,MAPK、SA、ROS等信号通路参与软腐病菌诱导的大白菜抗病防卫反应。

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