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大粒香基因组重测序分析

文献类型： 中文期刊

作者： 龙武华 1 ; 刘毅 2 ; 姜雪 1 ; 李祖军 1 ; 吴娴 1 ; 朱速松 1 ;

作者机构： 1.贵州省水稻研究所

2.开阳县禾丰布依族苗族乡农林水综合服务中心

关键词： 水稻;大粒香;基因组;重测序

期刊名称： 现代农业科技

ISSN： 1007-5739

年卷期： 2024 年 003 期

页码： 162-165,174

摘要： 大粒香是贵州省农业科学院水稻研究所从籼稻和粳稻杂交后代选育出来的优质常规稻,是优异的亲本资源.本文选择粳稻日本晴(Nip)基因组和籼稻R498基因组作为参考基因组,对大粒香基因组进行重测序分析.结果表明,大粒香基因组与籼稻R498基因组的SNP差异位点数为1840811个,基因组插入缺失位点数为395399个;大粒香基因组与粳稻日本晴(Nip)基因组的SNP差异位点数为586123个,基因组插入缺失位点数为129578个.可见,大粒香与粳稻日本晴(Nip)的SNP差异位点数和基因组插入缺失位点数都比籼稻R498少,表明大粒香与粳稻的遗传关系较大粒香与籼稻的遗传关系近.

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