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火龙果HuICE1基因的克隆与表达分析

文献类型: 中文期刊

作者: 陈翠 1 ; 王卓 1 ; 谢碧玉 1 ; 任陪娣 1 ; 徐碧玉 1 ; 金志强 1 ; 黄绵佳 1 ; 从心黎 1 ;

作者机构: 1.海南大学园艺学院热带生物资源教育部重点实验室;中国热带农业科学院热带生物技术研究所农业部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室;海南大学生命科学与药学院

关键词: 火龙果(Hylocereus undatus);HuICE1;基因克隆;表达分析

期刊名称: 分子植物育种

ISSN: 1672-416X

年卷期: 2019 年 23 期

页码: 7706-7713

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究以‘金都一号’红心火龙果(Hylocereus undatus)为实验材料,利用ICE序列3'端的高度保守结构域(bHLH),采用同源克隆法从火龙果果肉中分离得到一条HuICE1序列,其cDNA序列全长1 673 bp,具有一个1 596 bp的完整开放阅读框,生物信息学分析显示该基因编码的蛋白定位于细胞核,为水溶性蛋白。蛋白结构预测发现,HuICE1蛋白属MYC2型转录因子,在3'端第340~384个氨基酸含有高度保守的bHLH结构域,表明HuICE1基因属bHLH家族,还有核定位信号(NLS)区、富S区、转膜区、类泛素化(SUMO)结合位点各1个。同源性分析表明,火龙果与甜菜(Beta vulgaris)的核苷酸序列相似度最高,为85.10%。qRT-PCR表达分析表明,在火龙果各个组织中HuICE1均有表达,说明该基因是组成型表达,此研究为后续研究火龙果抗逆机制提供理论依据。

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