文献类型： 中文期刊

作者： 周阳 ¹ ; 李本旺 ¹ ; 林强 ¹ ; 付小哲 ¹ ; 李敏 ¹ ; 梁红茹 ¹ ; 刘礼辉 ¹ ; 卢伟华 ¹ ; 李宁求 ¹ ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院珠江水产研究所农业部渔用药物创制重点实验室广东省水产动物免疫技术重点实验室;上海海洋大学水产与生命学院;广东省东莞市水生动物防疫检疫站

关键词： 云斑尖塘鳢;转录组;传染性脾肾坏死病毒;鳜弹状病毒;免疫应答

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2019 年 10 期

页码： 4404-4412

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为阐明云斑尖塘鳢对病毒灭活疫苗的免疫应答机制,本研究采用RNA-sequencing技术结合生物信息学方法分析了传染性脾肾坏死病毒、鳜弹状病毒二联灭活疫苗接种云斑尖塘鳢后脾脏转录谱。分别构建疫苗接种后7 d、14 d脾脏cDNA文库并对其进行高通量测序,共获得85 547条Unigenes,其中32 386条Unigenes被注释;共筛选得到13 593个差异表达基因,其中免疫后7 d上调基因1 291个、下调基因2 030个,14 d上调基因3 732个、下调基因6 540个。GO功能注释显示,差异表达基因编码蛋白主要与免疫应答、细胞黏附以及细胞增殖相关;KEGG分析表明差异表达基因集中在细胞-细胞受体互作通路、细胞粘附分子通路和MAPK信号通路等。选取差异表达的IL-1β、IL-12、MHCⅠ、MHCⅡ等4个基因进行qPCR验证,结果与转录谱结果相符。研究结果为阐明云斑尖塘鳢对传染性脾肾坏死病毒、鳜弹状病毒二联灭活疫苗的免疫应答机制提供依据。