文献类型： 中文期刊
作者： 李红霞 1 ; 李建林 2 ; 唐永凯 2 ; 俞菊华 2 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心
2.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心,农业部淡水渔业和种质资源利用重点实验室
关键词： 建鲤;鸟氨酸脱羧酶;基因型;SNP-增重相关分析
期刊名称： 水生生物学报
ISSN： 1000-3207
年卷期： 2014 年 38 卷 03 期
页码： 414-421
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 构建了建鲤(Cyprinus carpio var.jian)鸟氨酸脱羧酶(Ornithine decarboxylase,ODC)jlODC1a基因上6个和jlODC1b基因上4个SNP位点的PCR-RFLP方法,检测了这10个位点在12个家系约900尾建鲤选育群体中的基因型,各位点的基因型频率存在差异,最小等位基因频率(MAF)为0.14—0.48。各位点不同基因型与增重相关分析结果,其中7个SNPs与建鲤增重显性相关的位点,ODC1s基因上与雌鱼增重相关的SNP位点(7个)较雄鱼(4个)多。标记富集结果表明富集与建鲤增重相关的优势基因型的SNP个数越多的个体增重速度越快SNP个数越多的个体增重速度越快,富集4个的平均增重显著快于富集0—3的个体增重,且比0标记的快约14%,这反映出生长为数量性状。进一步对所检测位点进行双倍型分析,结果显示具有四个优势基因型且全部杂合优势基因型的4567(XXXXXXACCTCTCT)组的增重最快,比0优势基因型的增重快达26.6%,可以考虑用于今后的快增长建鲤的选育计划中。此外,双倍型分析结果还表明,不同位点之间可能存在或颉抗或协同的互作,如1和4之间存在拮抗关系,因此在今后的选育计划中,在考虑标记富集的情况下还应考虑标记之间的关系。宜在选择互为协同作用优势基因型的前提下,富集尽可能多的SNP标记。
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