文献类型： 中文期刊
作者： 罗勤川 1 ; 孙厚俊 1 ; 唐伟 1 ; 谢逸萍 1 ; 杨冬静 1 ; 马居奎 1 ; 陈晶伟 1 ; 高方园 1 ; 张成玲 1 ;
作者机构： 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/中国农业科学院甘薯研究所/农业农村部甘薯生物学与遗传育种重点实验室
关键词： 甘薯长喙壳菌;多糖单加氧酶;生物信息学;克隆;基因表达
期刊名称： 中国农学通报
ISSN： 1000-6850
年卷期： 2023 年 39 卷 027 期
页码： 103-109
收录情况： CSCD
摘要： 为明确甘薯长喙壳菌致病相关基因多糖单加氧酶基因(CfCel61A)在病菌侵染甘薯中的表达模式及编码蛋白的理化特性.以11株来自不同地区的菌株为材料,克隆并利用生物信息学软件明确CfCel61A蛋白理化性质,用qRT-PCR分析基因表达.结果表明,CfCel61A编码区均为1155 bp,一致率99.5%~100%,编码384个氨基酸,一致率为98.4%~100%;分子量为34.49kDa,等电点为5.59,亲水系数为-0.195,是稳定的亲水蛋白;N端有一个信号肽,亚细胞定位在核内,无跨膜结构;含58个磷酸化和2个糖基化位点,蛋白二级结构无规则卷曲占比最高,为69.01%.CfCel61A在病菌侵染中表达量显著上调,但不同侵染阶段上调幅度不同,侵染'南京92'和'徐薯37'后分别在12h和6h达到最高.综上,CfCel61A在C.fimbriata侵染甘薯中可能发挥重要作用,可为病害药剂开发提供新靶标.
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