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长喙壳菌侵染甘薯的转录组分析

文献类型: 中文期刊

作者: 杨冬静 1 ; 高方园 1 ; 陈晶伟 1 ; 马居奎 1 ; 唐伟 1 ; 梁昭 1 ; 张成玲 1 ; 孙厚俊 1 ; 谢逸萍 1 ;

作者机构: 1.江苏徐淮地区徐州农业科学研究所/农业农村部甘薯生物学与遗传育种重点实验室

关键词: 甘薯;长喙壳菌;转录组测序;差异表达基因;致病机理

期刊名称: 江苏农业学报

ISSN: 1000-4440

年卷期: 2025 年 41 卷 007 期

页码: 1320-1331

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 甘薯黑斑病是由长喙壳菌(Ceratocystis fimbriata Ellis et Halsted)侵染引起的,该病害是甘薯重要病害之一,在田间生产和贮藏期均可发生,严重影响甘薯的产量和品质。为了明确长喙壳菌对甘薯黑斑病的致病机理,本研究以甘薯黑斑病抗病品种南京92和感病品种徐薯18为试验材料,采用针刺接种孢子悬浮液的方法人工接种甘薯长喙壳菌,分别于接种当天与接种后第1 d、第3 d、第7 d取样,利用转录组测序技术进行测序分析。转录组测序结果显示,与接种当天相比,长喙壳菌接种至南京92薯块后第1 d、第3 d和第7 d上调差异表达基因(DEGs)分别为1 124个、1 713个和2 032个,下调DEGs分别为869个、1 042个和1 005个;长喙壳菌接种至徐薯18薯块后第1 d、第3 d和第7 d上调DEGs分别为901个、1 625个和1 957个,下调DEGs分别为1 017个、976个和1 032个。GO功能富集分析结果表明,差异表达基因主要富集于生物过程类别的生物进程、代谢进程、单一生物进程以及细胞组分类别的细胞、细胞部分、细胞器等。KEGG通路富集的主要通路为代谢途径。维恩图分析结果表明,长喙壳菌接种至南京92薯块后不同时间点共有DEGs为1 545个,接种至徐薯18薯块后不同时间点共有DEGs为1 116个,对这些DEGs进行交互分析,发现接种至2个甘薯品种薯块后在各时间点共有的DEGs有925个。对925个共有DEGs进行KEGG聚类分析,结果表明,这些DEGs主要被富集到代谢通路中,如碳水化合物代谢、脂质代谢、氨基酸代谢、核苷酸代谢、辅因子和维生素代谢以及能量代谢等途径中,进一步对这些DEGs进行筛选,得到相对表达量高于1.00、持续上调表达并且差异表达倍数达到40倍以上的关键致病基因共20个。本研究结果为深入研究长喙壳菌致病分子机理奠定了重要基础。

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