文献类型： 中文期刊
作者： 李旭凯 1 ; 王钇杰 1 ; 王俊杰 1 ;
作者机构： 1.山西农业大学生命科学学院;特色杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室;农业部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室;山西农业大学农学院
关键词： Enrich＿analysis.pl;perl脚本;富集分析;Fisher-s Exact Test;检验
期刊名称： 生物信息学
ISSN： 1672-5565
年卷期： 2018 年 16 卷 03 期
页码： 178-183
摘要： 如何从庞大的基因表达数据库里挖掘出有价值的信息,并做出科学的生物学诠释,是基因表达分析领域的重要挑战。富集分析为解决这一问题提出了合理的方案。用Perl语言写了一个脚本——Enrich_analysis.pl,可根据基因注释信息进行基因富集分析,并利用Fisher's Exact Test做检验。富集分析先根据生物学知识将基因归类,然后进行基因差异表达分析,提高数据的可解释性。并利用3篇SCI文章的差异基因数据,对本perl脚本进行了对比测试,证明本perl脚本算法正确可靠。
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