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基于荧光检测的糜子Genic-SSR PCR体系优化

文献类型: 中文期刊

作者: 李耀深 1 ; 曹鑫 1 ; 段明 1 ; 王俊杰 1 ; 张彬 1 ; 李红英 1 ; 侯思宇 1 ; 韩渊怀 1 ;

作者机构: 1.山西农业大学

关键词: 糜子;Genic-SSR;体系优化;正交试验设计

期刊名称: 山西农业大学学报(自然科学版)

ISSN: 1671-8151

年卷期: 2016 年 36 卷 07 期

页码: 477-482

摘要: [目的]本研究基于Fragment Analyzer全自动毛细管电泳荧光检测系统,以期建立一个最优的糜子GenicSSR分子标记PCR反应体系。[方法]试验采用L16(44)正交设计,设计了Taq DNA聚合酶、Mg2+、dNTPs和引物的不同浓度组合,并用Pragment Analyzer全自动毛细管电泳荧光检测系统检测PCR产物。[结果]Taq DNA聚合酶、Mg2+、dNTPs、引物浓度对PCR反应效应为:Mg2+>引物>dNTPs>Taq DNA聚合酶。通过正交实验设计确立了糜子Genic-SSR荧光PCR检测体系的最佳反应组分:20μL的反应体系中包含0.2 mmol·L-1的dNTPs,0.2μmol·L-1引物,1.5mmol·L-1的Mg2+和0.5U的Taq DNA聚合酶。[结论]本研究建立了糜子的Genic-SSR分子标记的最佳荧光PCR反应体系,为糜子种质资源遗传多样性分析中分子标记开发、验证和辅助育种奠定了基础。

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