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水稻与稻瘟病菌不同小种互作的基因差异表达谱分析

文献类型: 中文期刊

作者: 姜兆远 1 ; 任金平 1 ; 刘晓梅 1 ; 邹晓威 1 ; 郭晓莉 1 ; 王继春 1 ; 温嘉伟 2 ; 刘文平 2 ; 夏海丰 3 ; 洪德志 4 ;

作者机构: 1.吉林省农业科学院中国农业科技东北创新中心

2.吉林省农业科学院植物保护研究所

3.吉林省通化市农业科学院

4.吉林省农业技术推广总站

关键词: 稻瘟病;基因表达谱;基因芯片

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2013 年 46 卷 24 期

页码: 5123-5131

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】分析水稻接种稻瘟病菌(Magnaporthe grisea)48 h后亲和互作与非亲和互作反应的基因表达谱,探索水稻对不同稻瘟病菌抗性差异的分子机理。【方法】运用Affymetrix表达谱芯片分析差异表达mRNA;通过分子注释系统平台(MAS 3.0)对差异表达基因进行了基因注释及GO分析;应用实时定量PCR对部分差异表达基因进行验证。【结果】在49 824个转录本中共检测到大约24 000个转录本,Fold change大于2.5的基因共1 028个,其中非亲和互作上调基因460个,下调基因568个。所验证的4个基因的荧光定量PCR结果与芯片结果基本一致。经GO分析差异基因对应蛋白的功能主要涉及信号转导、酶的调节、转录及分子转运等。【结论】水稻与稻瘟病菌非亲和与亲和互作的基因表达谱存在较大差异,基因芯片筛选到的差异表达基因通过GO注释明确了差异基因的分子功能及信号通路,有利于进一步了解植物抗病机制,并可能为稻瘟病防治措施提供新的途径。

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