您好,欢迎访问黑龙江省农业科学院 机构知识库!

猪hnRNPUL1基因克隆及变异剪接体鉴定

文献类型: 中文期刊

作者: 宋艳芳 1 ; 张彩霞 1 ; 杜芳芳 1 ; 马骏杰 1 ; 刘东宇 1 ; 刘娣 1 ; 杨秀芹 1 ;

作者机构: 1.东北农业大学动物科学技术学院;黑龙江省农业科学院

关键词: 猪;hnRNPUL1;克隆;变异剪接体

期刊名称: 畜牧兽医学报

ISSN: 0366-6964

年卷期: 2020 年 03 期

页码: 443-451

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 旨在克隆民猪hnRNPUL1基因全长编码区(complete coding sequence, CDS)序列并进行可变剪接分析,研究其组织表达和亚细胞定位情况。本研究以3头3月龄民猪为试验材料,利用RT-PCR技术克隆hnRNPUL1基因CDS及可变剪接体,应用qRT-PCR检测其在心、肝、脾、肺、肾、胃、大肠、小肠、背肌、腿肌等组织中的表达情况,同时,在生物信息学预测的基础上,通过融合表达绿色荧光蛋白的方法鉴定核定位序列。研究结果表明,猪hnRNPUL1基因(GenBank accession No.:MN399154) CDS全长2 580 bp,预期编码的多肽链存在着hnRNPs家族的特征性结构域——SAP、SPRY和AAA;猪hnRNPUL1普遍表达于所检测的各组织中,其中在脾脏中表达量最高,在腿肌中表达量最低;核定位序列(NLS)位于多肽链的133~430 aa处,与生物学信息学预测的结果存在着偏差;同时获得了2个变异剪接体和11种可变剪接片段。本研究结果对进一步揭示猪hnRNPUL1基因功能及转录调控机制提供了基础。

  • 相关文献

[1]绵羊IGF-Ⅰ基因Ⅱ类变异剪接体生物信息学及组织表达分析. 宋旭婷,翟羽飞,张嘉楠,亓美玉,王志鹏,付晶,姚玉昌. 2019

[2]野猪、家猪及其杂种猪ACSL4基因部分内含子的克隆和多态性分析. 郭丽娟,杨秀芹,王秀奎,姜薇,刘娣. 2007

[3]猪PILRA基因克隆及变异剪接体鉴定. 李利族,韩丽鑫,王金奎,汪亮,刘娣,杨秀芹. 2015

[4]猪CAPN3基因的克隆及PCR-SSCP分析. 邢明伟,孙丽华,刘娣. 2010

[5]猪的RBP4基因部分序列的克隆及多态性分析. 杨龙,张冬杰,汪晓鸿,王文涛,刘琪,刘娣. 2007

[6]猪MEF2a基因的克隆与表达. 高智晟,杨龙,张冬杰,刘娣. 2009

[7]猪ECH1基因部分序列的遗传变异分析. 张冬杰,刘娣,汪亮,王文涛,杨国伟. 2011

[8]家畜胚胎克隆关键技术及应用研究. 宋雪莹,佟桂芝,宋斌,李平,刘德会,李玉龙,丁丽艳,李同豹. 2020

[9]猪嵌合RNA BCL2L2CR克隆与功能初步分析. 杨秀芹,张晓涵,郝婉君,张倩,李佳欣,何鑫淼,庞宇. 2022

[10]猪GSTM2基因的多态性及与生产性状相关性分析. 王嘉博,祝继原,俄广鑫,杨少成,刘娣. 2011

[11]不同品种猪LPL基因的PCR-RFLP分析. 王文涛,何鑫淼,彭富刚,汪博,刘娣. 2009

[12]同源重组敲除MSTN基因的猪胎儿成纤维细胞的构建. 李景芬,于浩,袁野,刘娣. 2009

[13]猪LXRα基因的克隆、序列分析及表达研究. 于浩,刘娣,丁镌. 2009

[14]Cst B基因在90日龄大白猪不同组织中的表达研究. 王文涛,何鑫淼,张冬杰,彭福刚,吴赛辉,刘娣. 2010

[15]猪HNF-4α基因多态性与肌纤维组织学特性及生长性状的相关性分析. 祝继原,刘娣,王嘉博,俄广鑫,杨少成,郭全和. 2011

[16]成熟培养基对猪卵母细胞的影响. 郭云云,付博,马红,康雅雅,刘娣. 2012

[17]猪精液颗粒冷冻技术的研究. 赵祥杰,李玉田,孙爽,宋军,刘丽清,尹智,田江天,郑重,刘娣,刘忠华. 2008

[18]猪子宫内膜基质细胞和腺上皮细胞的分离培养. 赵诚悦,马红,郭镇华,张东杰,汪亮,刘娣. 2013

[19]猪TLR5基因定点突变表达载体构建. 李海涛,陈月婵,牛艳春,李朋,刘娣,杨秀芹. 2012

[20]不同猪种腿肌中Cst B基因的表达研究. 王文涛,何鑫淼,张冬杰,彭福刚,吴赛辉,刘娣. 2014

作者其他论文 更多>>