文献类型: 中文期刊
作者: 宋艳芳 1 ; 张彩霞 1 ; 杜芳芳 1 ; 马骏杰 1 ; 刘东宇 1 ; 刘娣 1 ; 杨秀芹 1 ;
作者机构: 1.东北农业大学动物科学技术学院;黑龙江省农业科学院
关键词: 猪;hnRNPUL1;克隆;变异剪接体
期刊名称: 畜牧兽医学报
ISSN: 0366-6964
年卷期: 2020 年 03 期
页码: 443-451
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 旨在克隆民猪hnRNPUL1基因全长编码区(complete coding sequence, CDS)序列并进行可变剪接分析,研究其组织表达和亚细胞定位情况。本研究以3头3月龄民猪为试验材料,利用RT-PCR技术克隆hnRNPUL1基因CDS及可变剪接体,应用qRT-PCR检测其在心、肝、脾、肺、肾、胃、大肠、小肠、背肌、腿肌等组织中的表达情况,同时,在生物信息学预测的基础上,通过融合表达绿色荧光蛋白的方法鉴定核定位序列。研究结果表明,猪hnRNPUL1基因(GenBank accession No.:MN399154) CDS全长2 580 bp,预期编码的多肽链存在着hnRNPs家族的特征性结构域——SAP、SPRY和AAA;猪hnRNPUL1普遍表达于所检测的各组织中,其中在脾脏中表达量最高,在腿肌中表达量最低;核定位序列(NLS)位于多肽链的133~430 aa处,与生物学信息学预测的结果存在着偏差;同时获得了2个变异剪接体和11种可变剪接片段。本研究结果对进一步揭示猪hnRNPUL1基因功能及转录调控机制提供了基础。
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