文献类型： 中文期刊
作者： 王修芳 1 ; 刘庆慧 2 ; 吴垠 1 ; 黄倢 2 ;
作者机构： 1.大连海洋大学大连
2.农业部海洋渔业可持续发展重点实验室中国水产科学研究院黄海水产研究所青岛
关键词： 中国明对虾;coat-ε;基因克隆;组织分布
期刊名称： 渔业科学进展
ISSN： 2095-9869
年卷期： 2016 年 37 卷 04 期
页码： 147-152
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： coat-ε基因表达的蛋白是组成COPⅠ的coatomer复合体的一个亚基,为获得中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)coat-ε基因全长序列,采用cDNA末端快速扩增(Rapid amplification of cDNA end,RACE)技术,扩增出coat-ε基因的3端和5端,测序结果经DNAMAN比对拼接得出coat-ε基因全长,基因全长1402 bp,5非编码区(UTR)84 bp,3'非编码区(UTR)310 bp,开放阅读框1008 bp,预测编码335个氨基酸,其中,第230–300的氨基酸属于TPR超家族,Signal P 3.0 Server预测氨基酸序列没有信号肽,TMHMM Server v.2.0分析此氨基酸不存在跨膜结构,PSORTⅡPrediction预测该蛋白位于线粒体、细胞质、内质网中,属胞内蛋白。系统进化树显示,中国明对虾的coat-ε基因与节肢动物门的动物亲缘关系相近。采用实时荧光定量方法分析该基因在鳃、上皮、胃、肌肉、肝胰腺等不同组织中的相对表达,结果显示,coat-ε在肌肉中的相对转录表达量最高,在鳃和附肢的表达次之。本研究获得的中国明对虾coat-ε全长序列,可为该基因功能研究提供基础。
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