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深圳海域斑节对虾野生种群线粒体控制区序列的多态性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 姜永杰 1 ; 周发林 1 ; 黄建华 1 ; 马之明 1 ; 江世贵 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院南海水产研究所

关键词: 斑节对虾;线粒体;控制区序列;遗传多样性

期刊名称: 南方水产

ISSN: 1673-2227

年卷期: 2006 年 2 卷 01 期

页码: 58-61

摘要: 采用聚合酶链式反应技术对深圳斑节对虾种群的20个个体进行了分析,通过对mtDNA的控制区基因序列进行扩增,获得了大小约为650bp的扩增产物。PCR产物经纯化后进行序列测定,得到了526bp的核苷酸序列。用Clustal_X排序软件对控制区序列进行了对位排列。通过Mega软件对所得线粒体控制区序列的片段进行比较,共检测出114个碱基存在变异,其中包括84个简约信息位点,5个碱基存在插入/缺失;并用Mega的“Pairwise distance”计算个体间的相对遗传距离。结果表明:其序列差异(转换+颠换)在0·010~0·154之间,得出20个个体有20种单倍型;并构建了UPGMA和NJ系统树。运用DNASP软件计算所得该群体核苷酸多样性(Pi)和平均核苷酸差异数(K)分别为0·05278和27·500。研究结果表明:深圳斑节对虾野生种群控制区序列个体变异程度很大,该种群的遗传多样性水平很高,适合于群体内及群体间不同个体的遗传多样性分析。

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