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嗜水气单胞菌气溶素和溶血素基因的克隆与结构预测

文献类型： 中文期刊

作者： 刘明智 1 ; 叶星 1 ; 田园园 1 ; 邓国成 1 ; 马冬梅 1 ; 白俊杰 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院

关键词： 嗜水气单胞菌;气溶素;溶血素;基因;序列

期刊名称： 江西农业大学学报

ISSN： 1000-2286

年卷期： 2010 年 32 卷 02 期

页码： 164-170

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 从患出血病草鱼体上分离出1个菌株,传统分类学及16SrRNA基因鉴定其为嗜水气单胞菌,人工感染实验显示该分离菌株为强毒株。克隆该菌株的气溶素(aerolysin,aerA)基因和溶血素(hemolysin,hlyA)基因,序列分析显示这2个基因只有46.7%的同源性。Blast分析显示,hlyA基因与GenBank上已登录的hlyA序列具有较高的同源性,而aerA基因与已登录的aerA基因以及一些hlyA序列也具有较高的同源性。对与aerA基因同源性较高的这些hlyA序列进行结构域预测,发现它们均具有APT结构域和气溶素结构域,说明它们实际上应是aerA基因,只是命名上与hlyA基因混淆。用DNAstar软件预测aerA和hlyA的抗原区,显示它们均具有很好的抗原性。用特异性引物检测菌株的aerA基因和hlyA基因,结果显示2株毒力株均有特异条带,而无毒株则未扩增到特异条带,说明aerA和hlyA有可能作为鉴定嗜水气单胞菌毒力菌株的标记。

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