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利用InDel标记分析23份黄瓜种质的遗传多样性及核心种质资源筛选

文献类型： 中文期刊

作者： 张红梅 1 ; 翟文 2 ; 金海军 1 ; 丁小涛 1 ; 余纪柱 1 ;

作者机构： 1.上海市农业科学院设施园艺研究所

2.东华理工大学化学生物与材料科学学院

关键词： 黄瓜;InDel标记;核心种质;遗传多样性

期刊名称： 上海农业学报

ISSN： 1000-3924

年卷期： 2019 年 35 卷 004 期

页码： 28-33

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究不同来源黄瓜的亲缘关系,筛选适宜作杂交亲本的种质资源,基于黄瓜重测序开发的InDel标记,应用UPGMA进化树聚类、主成分分析和群体遗传结构分析3种方法分析了23份黄瓜种质的遗传多样性.结果 表明:23份黄瓜种质的遗传相似性系数为0.23-0.95,平均值为0.56,相似性系数低于0.6的有137对组合,占全部组合的54%,说明这些材料的遗传多样性较好.3种分析方法均将23份黄瓜种质分为三大类群:P1来源于亚洲,都属于华南类型黄瓜;P2来源于欧洲和美国,包含欧洲类型长黄瓜、欧洲类型短黄瓜和2个美国加工型黄瓜;P3仅包含1个来源于广东的品种,从表型上看属于华南类型.P3亲缘关系更接近P1,P1和P2之间遗传差异明显.利用InDel标记分析的结果,对核心种质最佳样本量进行了预测,应用M策略将9份黄瓜种质确定为核心种质,包含了群体中几乎所有的黄瓜类型,外形上有白刺、褐刺以及光滑型,这9份核心种质能够很大范围地覆盖表型的变异.

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