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向日葵HaKAR1基因的生物信息学和表达分析

文献类型： 中文期刊

作者： 周菲 1 ;

作者机构： 1.黑龙江省农业科学院 博士后科研工作站

关键词： 向日葵;油酸;HaKAR1;生物信息学;表达分析

期刊名称： 黑龙江农业科学

ISSN：

年卷期： 2021 年 010 期

页码： 19-22

摘要： KAR编码β-酮脂酰-ACP还原酶,是在脂肪酸合成过程中催化酮脂酰还原反应的酶。为了解向日葵HaKAR1基因的表达特性及功能,对向日葵HaKAR1编码蛋白进行生物信息学分析和基因表达模式分析,预测HaKAR1编码蛋白为碱性蛋白且为亲水性蛋白,蛋白二级结构主要为α螺旋,预测亚细胞定位于叶绿体。系统进化分析发现,HaKAR1与莴苣（Lactuca sativa L.）KAR1进化关系最近,序列相似性高达90%。基因表达模式分析发现,HaKAR1在向日葵种子、舌状花和管状花中表达量较高,其次为茎、叶,在根中不表达。HaKAR1在高、低油酸向日葵种子开花后7～27d表达均呈先上升后下降再上升的趋势,但在开花后37d,低油酸材料种子中表达量明显高于高油酸材料,表明HaKAR1在高、低油酸种子发育后期可能存在不同表达调控机制。

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