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用鲤鱼EST-SSRs分子标记分析长江黑龙江鲤种群结构

文献类型: 中文期刊

作者: 鲁翠云 1 ; 全迎春 1 ; 李大宇 1 ; 孙效文 1 ; 梁利群 1 ;

作者机构: 1.中国水产科学研究院黑龙江水产研究所

关键词: 鲤鱼EST-SSRs;微卫星;遗传多样性

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1006-1304

年卷期: 2007 年 15 卷 06 期

页码: 41-46

收录情况: CSCD

摘要: 从鲤鱼(Cyprinus carpio)ESTs的数据库(10691个)中进行微卫星序列筛选,共发现微卫星序列127个,占整个ESTs数据库的1.19%;另外从本研究室构建的鲤鱼脑组织cDNA文库中筛选到微卫星序列20个。根据筛选得到的微卫星序列设计引物68对,合成引物40对,其中27对引物能够获得预期的目的片段,20对引物在所检测的群体内及群体间表现出多态性。用此20对引物标记的多态性分析了长江鲤(Cyprinus carpio)和黑龙江鲤(C.carpio var haematopaerus.Temminck et Schlegel)的群体遗传结构,结果表明:长江鲤和黑龙江鲤在多数位点表现出较高的遗传多样性,20个位点的平均有效等位基因数分别为3.9135和3.4820;平均观察杂合度为0.6067和0.5667;平均期望杂合度为0.6737和0.6194;平均多态信息含量为0.6308和0.5714。长江鲤的遗传结构好于黑龙江鲤,两个群体的Hardy-Weinberg偏离指数较小,群体基本保持平衡,群体结构较合理;其中HLJE1和HLJE10位点在长江鲤和黑龙江鲤的扩增结果相差较大,长江鲤的多态性明显高于黑龙江鲤,位点多态信息含量相差1倍以上,可用于群体的鉴别。

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