文献类型： 中文期刊
作者： 程远 1 ; 郭勤卫 1 ; 郑佳秋 1 ; 万红建 2 ;
作者机构： 1.;苏州农业职业技术学院;浙江省植物有害生物防控重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地浙江省农业科学院蔬菜研究所;衢州市农业科学研究院;江苏沿海地区农业科学研究所
2.;苏州农业职业技术学院;浙江省植物有害生物防控重点实验室—省部共建国家重点实验室培育基地浙江省农业科学院蔬菜研究所;衢州市农业科学研究院;江苏沿海地区农业科学研究所;
关键词： 辣椒;紫色酸性磷酸酶;基因家族;生物信息学;表达分析
期刊名称： 浙江农业学报
ISSN： 1004-1524
年卷期： 2017 年 09 期
页码： 1498-1505
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 紫色酸性磷酸酶(purple acid phosphatases,PAPs)属于金属磷酸酯酶家族,参与了植物大量的生理反应,特别是磷素的吸收与利用。本研究利用已经发表的辣椒基因组数据,采用同源比对方法对辣椒PAP基因家族进行鉴定与表达分析。通过鉴定发现辣椒基因组中至少含有25个PAP基因成员,氨基酸序列长度在264~639 aa,具有1~12个内含子,不均匀地分布在12条染色体上,仅发现1对基因以串联重复的形式存在。系统发育关系表明,辣椒、拟南芥和水稻PAP基因家族成员可以分为3个家族,8个亚家族,每个家族成员的数目是变异的,而且存在6对直系同源基因和20对旁系同源基因,这表明PAP基因家族的存在早于辣椒、拟南芥和水稻的分化。基于RNA-seq数据库和q RT-PCR方法,对辣椒PAP基因的组织表达及果实发育的不同时期进行分析,结果表明PAP家族基因具有组织表达特异性和发育时期表达特异性。
- 相关文献
[1]谷子COBRA家族成员的全基因组鉴定及表达模式分析. 任昂彦,陈环宇,王根平,施洋,陆镇威,陈涛,李晓莎,潘宗瑾,戚永奎,杨华. 2024
[2]藜麦SPP基因家族全基因组鉴定及表达模式分析. 陈紫岩,林参,尹航,张豪杰,魏真真,余希文,吴传万,李茹. 2022
[3]大豆GmGLRs基因全基因组鉴定与表达分析. 崔晓霞,赵硕,郭书巧,束红梅,何晓兰,倪万潮,巩元勇,刘来华. 2019
[4]茄子Whirly基因家族鉴定和表达分析. 梁书卿,周晓慧,杨艳,张静娴,刘松瑜,刘军,庄勇. 2024
[5]玉米FBA基因家族成员鉴定及表达分析. 苏在兴,黄忠勤,谢昊,李小珊,高闰飞. 2024
[6]辣椒CaWRKY8基因克隆及胁迫下的表达分析. 刁玄章,王述彬,刁卫平,潘宝贵,戈伟,高青海. 2019
[7]辣椒CaNAC55基因克隆与表达分析. 吴荡,刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,隋益虎. 2021
[8]辣椒全基因组WRKY转录因子的分析. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟. 2015
[9]辣椒WRKY转录因子的鉴别及进化分析. 刁卫平,王述彬,刘金兵,潘宝贵,郭广君,戈伟. 2014
[10]辣椒细胞质雄性不育相关基因的克隆与表达分析. 刘科伟,王述彬,刁卫平,戈伟. 2017
[11]辣椒DREB转录因子鉴定及其在涝害胁迫下的表达分析. 郑佳秋,王薇薇,梅燚,吴永成,万红建,潘宝贵,尤春,刘哲,沈峰,冯汝超. 2023
[12]辣椒花青素生物合成相关基因的表达分析研究. 李珍,刘金兵,刁卫平,王述彬,潘宝贵. 2014
[13]辣椒CaSYT1的鉴定及其在疫霉侵染过程中的功能初探. 刘艳艳,丁颖,刘兴华,郑佳秋,刘志钦. 2024
[14]辣椒生长素抑制蛋白基因CaARP1的克隆及其对青枯菌侵染的响应. 刘艳艳,丁颖,刘兴华,郑佳秋. 2023
[15]大丽轮枝菌异分支酸水解酶基因家族初步研究. 袁洪波,刘蔼民,张保龙. 2012
[16]葡萄miR159家族生物信息学分析及靶基因预测分析. 葛金涛,王丽丽,赵统利,刘兴满. 2018
[17]斑点叉尾鮰Cbx基因家族的全基因组鉴定与进化分析. 张世勇,陈校辉,王明华,钟立强,秦钦,邵俊杰,刘洪岩,王江,边文冀,Jiang Hucheng. 2019
[18]棉花基因组中赤霉素氧化酶基因的鉴定与分析. 赵亮,狄佳春,陈旭升. 2020
[19]玉米Glyco-hydro-16糖苷酶家族全基因组的鉴定及其遗传分化. 林峰,葛敏,周玲,赵涵. 2016
[20]棉花基因组中SABATH甲基转移酶基因家族的查找与分析. 赵亮,狄佳春,陈旭升. 2018
作者其他论文 更多>>
-
不同栽培模式对连作大棚青椒产量、品质和土壤细菌多样性的影响
作者：谢英添;刁卫平;郑佳秋;吴文丽;束秀玉;李长根;尤春
关键词：青椒;栽培模式;产量;品质;土壤细菌多样性
-
土壤改良剂和调理剂对设施辣椒产量及土壤性状的影响
作者：王薇薇;梅燚;吴永成;郑佳秋;尤春;赵春来;王佳伟
关键词：辣椒;土壤改良剂;土壤调理剂;产量;土壤指标
-
江苏地区设施西瓜栽培不同授粉方式效果对比
作者：刘哲;张洁;冯汝超;马江黎;沈峰;郑佳秋;尤春;王薇薇;张丽娜;祖艳侠;吴永成;张向向;邓晔;梅燚
关键词：西瓜;设施栽培;授粉;壁蜂
-
辣椒CaSYT1的鉴定及其在疫霉侵染过程中的功能初探
作者：刘艳艳;丁颖;刘兴华;郑佳秋;刘志钦
关键词：辣椒;CaSYT1;疫霉;基因鉴定;信号通路;表达分析
-
基于硫苷种类和含量分析的高品质水果萝卜种质筛选
作者：刘哲;沈峰;郑佳秋;王燕;祖艳侠;吴永成;王薇薇;张丽娜;冯汝超;张向向;高静;梅燚
关键词：水果萝卜;感官评价;硫苷;组分含量;LC-MS
-
2022-2023年江苏省豇豆区域筛选试验(盐城点)
作者：祖艳侠;冯汝超;郑佳秋;刘哲;沈峰;张丽娜;王薇薇;吴永成;梅燚
关键词：豇豆;江苏省;区域筛选试验;产量;盐城
-
瑞康盾微生物菌剂在秋季连作西瓜上的应用效果研究
作者：冯汝超;刘哲;郭绍贵;张丽娜;张洁;沈峰;郑佳秋;梅燚
关键词：瑞康盾微生物菌剂;秋季连作西瓜;产量;品质
