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山羊环状RNA circ_0008219 SNPs位点与生产性能的关联分析

文献类型: 中文期刊

作者: 赵华 1 ; 刘泽林 1 ; 杨娟 2 ; 张年 2 ; 刘静波 1 ; 陶虎 2 ;

作者机构: 1.西南科技大学生命科学与工程学院

2.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

关键词: circ_0008219;SNPs;山羊;繁殖性能;关联分析

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2024 年 60 卷 001 期

页码: 153-160

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 实验旨在分析山羊环状RNA circ_0008219 序列中单核苷酸多态性(Single Nucleotide Polymorphism,SNP)位点与产羔、生长性状之间的关联性,为山羊分子育种提供新的遗传标记.选取波尔山羊、黑头羊和麻城黑山羊作为实验对象,利用SNaPshot分型技术分析候选SNPs位点的遗传多样性,并对circ_0008219 的SNPs位点与 3 个品种山羊的产羔性状和黑头羊的周岁生长性状进行关联分析.结果表明山羊circ_0008219 中存在 3 个SNPs位点均具有多态性.卡方适应性检测结果表明,g.1082G>T、g.1310A>G在 3 个山羊群体中均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),g.651G>A在波尔山羊和麻城黑山羊群体均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05).黑头羊群体中,g.651G>A位点与山羊周岁体高存在相关;g.1082G>T与周岁体重、周岁体斜长、周岁胸围和管围性状存在相关.关联分析结果显示,g.651G>A位点与黑头羊总体产羔数显著关联,g.1082G>T位点与波尔山羊头胎产羔数极显著关联.连锁不平衡分析表明,在波尔山羊群体中,g.1082G>T和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=1,r2=1);在黑头羊群体中,g.651G>A和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=1,r2=1);在麻城黑山羊群体中,g.651G>A和g.1310A>G位点之间处于强连锁平衡状态(D'=0.917,r2=1).本研究筛选出 3 个SNPs位点即g.651G>A、g.1082G>T和g.1310A>G,可以作为山羊育种的潜在遗传标记,该研究结果为山羊品种培育提供了理论依据.

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