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旱柳转录组测序及生物学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 李敏 1 ; 郭聪 1 ; 李玉娟 1 ; 冯新民 1 ; 王莹 1 ; 张健 1 ; 谈峰 1 ;

作者机构： 1.江苏沿江地区农业科学研究所

关键词： 旱柳;转录组分析;盐胁迫;差异表达基因

期刊名称： 江苏农业学报

ISSN： 1000-4440

年卷期： 2019 年 35 卷 002 期

页码： 271-281

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 对盐敏感旱柳沿江柳和耐盐旱柳9901的杂交F1代根部进行了RNA-Seq测序和分析,共获取了107950条Unigene,平均长度为1076.96 bp.通过与COG、GO等8个数据库比对,60848个基因获得注释信息,其中38182条Unigene在GO数据库中获得注释,24101条Unigene在KEGG数据库中获得注释.GO和KEGG富集分析结果表明,差异表达基因主要调节核糖体代谢、植物激素信号转导等生物学功能.

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