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硒都黑猪NT5C1A基因核心启动子区鉴定及转录因子预测

文献类型: 中文期刊

作者: 任双 1 ; 吴俊静 2 ; 彭先文 2 ; 张志红 3 ; 周佳伟 2 ; 梅书棋 2 ; 乔木 2 ; 杜志强 1 ;

作者机构: 1.长江大学动物科学技术学院

2.湖北省农业科学院畜牧兽医研究所

3.江夏区农业农村局农业行政执法大队

关键词: 硒都黑猪;NT5C1A;核心启动子区;转录因子;生物信息学

期刊名称: 中国畜牧杂志

ISSN: 0258-7033

年卷期: 2024 年 008 期

页码: 116-121,128

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 本研究旨在探究猪胞质5'核苷酸酶1A基因(Cytosolic 5'-Nucleotidase1A,NT5C1A)启动子区序列的结构特性,确定其核心启动子区并分析其关键转录因子结合位点,为探究其表达调控机制提供理论依据。对NT5C1A互作蛋白进行预测,在线生物信息学分析软件预测猪NT5C1A基因核心启动子区,根据预测结果设计7对启动子缺失片段引物,以硒都黑猪血液基因组DNA为模板,通过PCR扩增和Sanger测序方法获得NT5C1A基因5'端7个启动子缺失片段并克隆至pGL3-Basic载体,以双荧光素酶报告基因检测试验对缺失片段进行荧光素酶活性检测,并通过转录因子在线预测软件预测核心启动子区潜在的转录因子。结果表明,NT5C1A基因核心启动子位于转录起始位点-290~+109bp的位置(ATG作为+1),该区域含有MYOD1、MYOG、MYF5和SP1等肌肉发育相关的转录因子结合位点。本试验为研究NT5C1A基因调控猪肌肉发育的分子机制提供了理论依据。

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