文献类型： 中文期刊
作者： 徐照龙 1 ; 易金鑫 2 ; 余桂红 2 ; 张大勇 2 ; 何晓兰 2 ; 王秀娥 1 ; 马鸿翔 2 ;
作者机构： 1.南京农业大学农学院
2.江苏省农业科学院农业生物技术研究所
关键词： 藜科;EST-SSR;遗传多样性;耐盐机制
期刊名称： 植物遗传资源学报
ISSN： 1672-1810
年卷期： 2011 年 12 卷 01 期
页码： 113-120
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 利用EST-SSR标记分析了藜科6种耐盐植物的遗传基础和遗传多样性,以期为藜科耐盐植物遗传育种提供快速、可靠的分子标记辅助选择工具。采用31对藜科海蓬子属和碱蓬属的EST-SSR引物对藜科6种植物进行PCR扩增,其中16对引物得到较好扩增,引物通用率为51.6%,共检测到18个多态性位点,每位点等位基因数2~4个,多态性丰富。进一步采用Nei’s遗传距离聚类分析表明6种植物可以分为3组,主成分分析也支持上述分组,而且DY529957、DY529903和DY5298853个EST在分组中贡献率最高。经与GenBank中序列相似性比对,前两者分别编码生长素抑制蛋白(Auxin-repressed protein,ARP)和植物防御素(Defensins,Def),都参与植物逆境胁迫响应,但分属于不同代谢途径;后者则编码未知蛋白。总体而言,16对SSR引物在藜科6种植物间具有较好的通用性,能够揭示该6种植物间广泛的遗传多样性,及其存在不同耐盐机制提供分子证据。
- 相关文献
[1]基于苹果EST-SSR的梨种质资源遗传多样性分析. 路娟,吴俊,张绍铃,吴华清,张妤艳. 2010
[2]海滨雀稗EST资源的SSR信息分析及EST-SSR标记开发. 李华勇,王显生,王艳平,吴燕,沈奇,贾新平. 2016
[3]辣椒EST-SSRs分布特征及其应用. 支莉,王述彬,刁卫平,刘金兵,潘宝贵,戈伟,于彩云. 2010
[4]植物耐盐性生理与分子机制研究进展. 刘云芬,彭华,王薇薇,郑佳秋,祖艳侠,吴永成,梅燚,郭军. 2019
[5]盐胁迫下陆地棉耐盐相关WRKY基因的表达分析. 蔡继鸿,徐鹏,张香桂,郭琪,徐珍珍,沈新莲. 2018
[6]Characterization of the global transcriptome using Illumina sequencing and novel microsatellite marker information in seashore paspalum. Jia, Xinping,Deng, Yanming,Sun, Xiaobo,Liang, Lijian,Ye, Xiaoqing.
[7]De novo assembly of the transcriptome of Neottopteris nidus using Illumina paired-end sequencing and development of EST-SSR markers. Jia, Xinping,Deng, Yanming,Sun, Xiaobo,Liang, Lijian,Su, Jiale.
[8]High-throughput development of simple sequence repeat markers for genetic diversity research in Crambe abyssinica. Qi, Weicong,Lin, Feng,Zhao, Han,Liu, Yuhe,Huang, Bangquan,Cheng, Jihua,Zhang, Wei. 2016
[9]藜麦EST-SSR的开发及通用性分析. 张体付,戚维聪,顾闽峰,张晓林,李坦,赵涵. 2016
[10]基于RNA-seq的两种柳树转录组微卫星特征比较分析. 郑纪伟,周洁,王保松,何旭东. 2019
[11]草莓EST-SSR标记的开发与应用. 王静,赵密珍,于红梅,王壮伟. 2011
[12]鸟巢蕨EST-SSR标记的开发与应用. 贾新平,邓衍明,孙晓波,梁丽建. 2015
[13]基于海甘蓝RNA-Seq序列开发EST-SSR分子标记. 戚维聪,程计华,黄邦全,李坦,林峰. 2014
[14]辣椒EST-SSR标记的开发. 李晶晶,王述彬,刘金兵,潘宝贵,陈劲枫. 2008
[15]玉米抗粗缩病自交系种质的发掘和遗传多样性及其在育种中的应用. 薛林,张丹,徐亮,金萌萌,彭长俊,徐辰武. 2011
[16]基于SSR标记的梨资源遗传多样性分析. 张妤艳,吴俊,张绍铃. 2008
[17]中粳水稻品种资源的遗传多样性Ⅱ.黄淮稻区近期育成品种的SSR多样性比较. 徐大勇,钟环,周峰,卢百关,樊继伟,方兆伟,秦德荣,万建民. 2010
[18]太湖稻区及国内部分香稻SSR指纹图谱构建及遗传多样性初析. 朱勇良,谢裕林,黄凌哲,吴建祥,乔中英,王建平,黄萌,陈培峰. 2012
[19]石榴分子标记的研究进展. 刘兴满,葛金涛,吴秋月. 2015
[20]江苏水稻主导品种的稻瘟病抗性及抗性基因遗传多样性. 李刚,王健,曹奎荣,李军,孙祥良,程保山,罗伯祥,杨子博,徐卫军,唐久友,储成才,袁彩勇. 2017
作者其他论文 更多>>
-
优质弱筋小麦新品种宁麦36的选育研究
作者：姚金保;杨学明;张鹏;余桂红;何漪;王化敦;范祥云
关键词：弱筋小麦;产量;栽培技术;宁麦36
-
弱筋小麦新品种‘宁麦36’的产量及品质性状分析
作者：姚金保;杨学明;张鹏;范祥云;余桂红;何漪;王化敦
关键词：弱筋小麦;‘宁麦36’;丰产性;稳定性;适应性;品质性状
-
不同种植模式对栝楼根际土壤微生物群落多样性的影响
作者：徐筋燕;何晓兰;邵明灿;万云龙;郭万君;施苏配;杨中海;潘明如;郭书巧
关键词：栝楼;轮作;微生物群落多样性;连作障碍
-
基于靶向测序技术的菜豆SNP液相芯片开发及验证
作者：袁娜;徐勤圆;徐照龙;周玲;刘晓庆;陈新;杜建厂
关键词：菜豆;单核苷酸多态性;靶向测序;遗传多样性
-
利用55K芯片进行小麦生育期相关性状的QTL定位及效应分析
作者：温明星;肖进;徐涛;孙丽;王宗宽;王海燕;王秀娥
关键词：小麦;生育期;QTL;SNP标记
-
不同小麦品种(系)拔节期耐渍性评价
作者：宋桂成;余桂红;张鹏;马鸿翔
关键词：小麦;耐渍性;因子分析;指数筛选
-
糖基转移酶基因TaUGT7分子表达特征及抗赤霉病作用分析
作者：何漪;刘祥;吴磊;姜朋;马鸿翔;张旭
关键词：小麦;赤霉病;UDP-葡萄糖基转移酶;脱氧雪腐镰刀菌烯醇
