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吉富罗非鱼IGF2基因分离及其单核苷酸多态性与体型、增重相关性

文献类型: 中文期刊

作者: 陈雪峰 1 ; 杨国梁 2 ; 俞菊华 3 ; 唐永凯 4 ; 李建林 3 ;

作者机构: 1.南京农业大学无锡渔业学院

2.浙江省淡水水产研究所

3.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心

4.中国水产科学研究院淡水渔业研究中心农业部水生动物遗传育种和养殖生物学重点开放实验室

关键词: 吉富罗非鱼;胰岛素样生长因子2;单核苷酸多态性;基因型;体型;增重;相关性

期刊名称: 动物学杂志

ISSN: 0250-3263

年卷期: 2010 年 45 卷 02 期

页码: 107-114

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 胰岛素样生长因子2(insulin-like growth factor2,IGF2)是控制动物生长和脂肪沉积的重要基因之一。本文采用PCR方法分离了吉富罗非鱼(GIFT strain Nile tilapia Oreochromis niloticus)IGF2基因5475bp,包含由4个外显子组成的整个阅读框669bp以及3个内含子。通过比对吉富罗非鱼10个个体IGF2序列,共发现11处单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,本文检测了内含子1的621nt(C/T)和外显子3的161nt(A/G)两位点在192尾吉富罗非鱼中的基因型分布,并分析不同基因型与体型、增重的相关性。使用四引物扩增受阻体系PCR检测内含子1的621nt基因型,结果显示,CC、CT、TT基因型频率在雄鱼中分别为0.32、0.32、0.36,在雌鱼中分别为0.38、0.38、0.24;与体型、增重的相关性分析表明,此位点不同基因型只与雄鱼体型(体高/体长)显著相关(P<0.05),CC型个体显著高于CT和TT型个体。外显子3的A/G转换导致了MSPⅠ酶切位点改变,使用PCR-RFLP法检测该位点基因型,结果显示整个群体中不存在AA基因型,在雄鱼中,GG、AG基因型频率分别为0.71、0.29,而雌鱼中则为0.75和0.25;与体型、增重的相关性分析表明,此位点不同基因型只与雄鱼增重极显著相关(P<0.01),GG型的雄鱼明显较AG型增重快。

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