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西伯利亚鲟促黄体激素受体基因的克隆及其生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 周洲 1 ; 孔杰 1 ; 赵振新 1 ; 赵飞 1 ; 吕盛寒 1 ; 刘霆 1 ;

作者机构: 1.贵州省水产研究所

关键词: 西伯利亚鲟;促黄体激素;受体;克隆;生物信息学;系统进化树

期刊名称: 贵州农业科学

ISSN: 1001-3601

年卷期: 2025 年 53 卷 001 期

页码: 62-69

收录情况: 北大核心

摘要: 【目的】阐明促黄体激素受体(Luteinizing hormone receptor, LHR)的生理功能和LHR基因在西伯利亚鲟性腺发育过程的功能作用,为鲟鱼的生殖调控提供参考。【方法】采用兼并引物扩展及RACE技术,克隆西伯利亚鲟LHR基因cDNA全长,并利用TMHMM、Signal 5.0等在线软件对LHR基因的理化性质、序列同源性等进行生物信息学分析。【结果】西伯利亚鲟LHR基因cDNA序列全长1 994 bp,包括开放性阅读框1 140 bp,共编码379个氨基酸,相对分子质量为43.02 kD,理论等电点为8.96,有35个正电荷氨基酸残基(Arg+Lys),24个负电荷氨基酸残基(Asp+Glu)。西伯利亚鲟LHR氨基酸序列与小体鲟、大西洋鲟、匙吻鲟和俄罗斯鲟均具有较高的同源性,达92%~98%。LHR蛋白具有7个跨膜结构域,具有G蛋白偶联受体家族蛋白典型保守区域。LHR基因编码的蛋白亲水性平均系数为0.435,属于疏水性氨基酸。二级结构模型显示,LHR蛋白中α-螺旋、无规则卷曲、延伸链以及β-转角的占比分别为41.69%、37.20%、19.53%及1.58%。三级结构模型显示,LHR蛋白主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。【结论】从西比利亚鲟卵巢组织成功克隆获得LHR基因cDNA全长序列,LHR氨基酸序列与小体鲟等具有较高的同源性,LHR基因编码的氨基酸序列对应的蛋白质为疏水性氨基酸,存在7个跨膜结构域,具有G蛋白偶联受体家族蛋白典型保守区域,LHR蛋白主要由α-螺旋和无规则卷曲组成。

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