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两种鲷属鱼类线粒体COI基因片段序列的比较

文献类型： 中文期刊

作者： 张凤英 1 ; 马凌波 1 ; 施兆鸿 1 ; 夏连军 1 ; 马春艳 1 ;

作者机构： 1.中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室

关键词： 鲷属;线粒体DNA;细胞色素氧化酶I亚基基因;序列分析

期刊名称： 上海水产大学学报

ISSN： 1004-7271

年卷期： 2006 年 15 卷 04 期

页码： 403-408

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 利用通用引物成功扩增了黄鳍鲷和黑鲷的线粒体细胞色素氧化酶I亚基(COI)基因序列。通过序列测定,得到581 bp的基因片段,碱基A、T、G、C平均含量分别为25.8%、32.6%、18.0%和23.6%,序列中的A+T含量明显高于G+C含量,与其他鱼类的COI基因片段研究结果相一致。通过序列分析发现黄鳍鲷和黑鲷两序列共存在14处碱基变异,其中在第19~139 bp之间检测到13个变异位点,是变异频率较高的区段,可以考虑作为鲷属或者种群鉴别的分子标记。与黄鲷、真鲷、三长棘真鲷等鱼类比较,无插入和缺失位点,转换明显高于颠换。序列差异比较结果显示,真鲷与黄鳍鲷的序列差异在这5种鱼类中最大,达到了18.2%,黄鳍鲷和黑鲷的差异最小(2.4%)。两个序列已提交到GenBank数据库中,序列登录号为:DQ185608和DQ185609。

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