文献类型： 中文期刊
作者： 胡伟胜 1 ; 王伟 1 ; 马凌波 1 ; 张凤英 1 ; 刘志强 1 ; 赵明 1 ; 马春艳 1 ;
作者机构： 1.中国水产科学研究院东海水产研究所遗传育种与生物技术实验室;上海海洋大学水产与生命学院,水产科学国家级实验教学示范中心
关键词： 拟穴青蟹;大眼幼体;饥饿;转录组
期刊名称： 海洋渔业
ISSN： 1004-2490
年卷期： 2023 年 45 卷 004 期
页码： 460-471
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： 为了探究甲壳类幼体应对饥饿胁迫的分子机理,以拟穴青蟹(Scylla paramamosain)为研究对象,设置正常投喂组和饥饿组,处理3d后对不同组别的拟穴青蟹大眼幼体进行转录组测序并开展生物信息学分析.De novo组装后共获得79581 个unigene,平均长度 1065.44 bp.Nr数据库共注释20061 个unigene.DESeq分析筛选出5621 个差异表达基因,饥饿组相比对照组2641 个上调、2980 个下调.基因本体论(GO)富集分析表明,共254 条GO Term显著富集(矫正后的P值小于0.05).京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析表明,共60 条KEGG pathway显著富集(矫正后的P值小于0.05).基于KEGG富集分析结果筛选了一系列与饥饿胁迫相关的代谢通路,如DNA复制、细胞凋亡、缬氨酸,亮氨酸和异亮氨酸代谢、亚油酸代谢、淀粉和蔗糖代谢.研究表明,饥饿胁迫干扰了拟穴青蟹大眼幼体的细胞分裂和凋亡,影响了体内的氨基酸代谢、脂质代谢和碳水化合物代谢.研究结果可为拟穴青蟹苗种的健康培育提供理论参考,并丰富拟穴青蟹的分子生物学基础数据.
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