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基于小RNA深度测序和RT-PCR检测侵染广东省冬种马铃薯的病毒

文献类型: 中文期刊

作者: 路秉翰 1 ; 汤亚飞 1 ; 于琳 1 ; 佘小漫 1 ; 邓铭光 1 ; 何自福 1 ;

作者机构: 1.广东省农业科学院植物保护研究所广东省植物保护新技术重点实验室

关键词: 马铃薯病毒病;小RNA深度测序;RT-PCR检测;病毒鉴定

期刊名称: 植物保护学报

ISSN: 0577-7518

年卷期: 2019 年 003 期

页码: 604-610

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为明确侵染广东省冬种马铃薯的病毒种类及优势病毒,结合小RNA深度测序技术及RTPCR检测方法,对采集于广东省冬种马铃薯7个主产区的189份疑似病样进行检测分析.结果表明,经小RNA深度测序技术检测马铃薯病毒病混合样,发现存在马铃薯Y病毒(Potato virus Y,PVY)、马铃薯S病毒(Potato virus S,PVS)和马铃薯卷叶病毒(Potato leaf-roll virus,PLRV)3种病毒.进一步设计3种病毒的特异性引物并利用国内已报道的其它5种马铃薯病毒的特异性引物进行RT-PCR检测,发现189份马铃薯病毒病疑似病样中仅检测到PVY、PVS和PLRV这3种病毒,检出率依次为75.13%、10.05%和4.76%,且3种病毒在马铃薯上还存在复合侵染,复合侵染率为14.19%,其中PVY在各马铃薯产区均可检测到.表明侵染广东省冬种马铃薯的病毒为PVY、PVS和PLRV,其中PVY是优势病毒.

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